gurobi已安装，但Matlab无法识别它

Question

Matlab16，Linux 16.04，Gurobi 6.5.2

我想在Matlab上使用Cobra toolobox，所以我也按照要求安装了Gurobi。 但是当我尝试这段代码时（正如研究文章中的解释：什么是FBA？Orth，Palsson）我收到了错误

代码

model = readCbModel('ecoli_core_model.xml') optimizeCbModel(model)

错误

`使用solveCobraLP时出错（第107行） 找不到解算器。调用changeCobraSolver（solverName）

optimizeCbModel中的错误（第213行）     solution = solveCobraLP（LPproblem）; `

在changeCobraSolver.m中，它说Gurobi是一个正确的解决者。显然，Matlab和Gurobi没有联系。

我在路径中添加了.../gurobi652/linux64/matlab，我尝试了（在此解释http://www.gurobi.com/documentation/6.5/refman/matlab_setting_up_the_guro.html）一个函数。我工作了。

我尝试安装Gurobi Mex（此处http://www.convexoptimization.com/wikimization/index.php/Gurobi_Mex:_A_MATLAB_interface_for_Gurobi），但我找不到Gurobi_mex.c

昨天optimizeCbModel工作但我不知道我做了什么以及改变了什么。

Answer 1

我注意到，如果我尝试testAll，那么optimizeCbModel会成功（至少没有错误）。我认为我们需要先initCobraToolbox。

Answer 2

1. 确保首先位于MATLAB目录的CobraToolbox文件夹中。呼叫initCobraToolbox

2. changeCobraSolver（'gurobi'，'all'）

3. 读取和优化功能现在都应该可以使用。

您可能会发现.mat文件更容易用于输入模型。这些可以在cobratoolbox->测试->模型->垫子

下找到

希望这会有所帮助