Question

作为一项长期政策，我避免将名称导入（也称为＃34;污染＆＃34;）当前范围，而是在引用不同包中定义的项目时使用完全限定名称。

下面的脚本显示，在R中，使用限定名称本身是不够的。

#!/usr/bin/env Rscript

set.seed(0)

x <- local({
         x0 <- matrix(rnbinom(80, size = 5, mu = 10), nrow = 20)
         `rownames<-`(rbind(0, c(0, 0, 2, 2), x0),
                      paste("Tag", 1:(nrow(x0) + 2), sep = "."))
     })

y <- edgeR::DGEList(counts = x,
                    group = rep(1:2, each = 2),
                    lib.size = 1001:1004)

## library(edgeR)

y[1, 1]

脚本失败并带有

Error in y[1, 1] : incorrect number of dimensions
Execution halted

脚本的唯一犯罪似乎没有在失败的语句之前的某处包含行library(edgeR)，因为如果取消注释掉注释掉的行，错误就会消失。

这是伏都教，imho。

有没有办法避免错误而不会使用library(edgeR)来污染当前范围？

Answer 1

如果您避免加载edgeR包，则还要避免加载[.DGEList方法，这是执行y[1, 1]所必需的。如果您不想加载edgeR库，则需要直接调用提取函数：

edgeR::`[.DGEList`(y, 1, 1)

如果您不喜欢完全限定的语法，可以使用

引入所需的方法

`[.DGEList` <- edgeR::`[.DGEList`

然后y[1, 1]将按预期工作。但这是另一种形式的污染，我不确定我是否会将其作为一般解决方案推荐。

如何避免污染当前范围（使用`library（...）`）

1 个答案: