网络分析：如何从csv创建节点和边缘文件

Question

我有一个csv格式的双模式（授予X人）网络。我想创建这个网络的personXperson投影并计算一些网络措施（包括亲密度和中介性的中心度量等）。

我的第一步是什么？我猜测为节点和边创建2个单独的文件，并使用igraph包在R中运行分析？！

这是我的数据的超简化版本（my_data.csv）。

• 格兰特，人
• A，1
• A，2
• B，2
• B，3

Answer 1

决定图表如何表示数据。根据您所描述的方法，一种方法是让图表中的节点代表人物，边缘代表授权。在这种情况下，创建一对在同一个拨款上的人。默认情况下，边缘在iGraph中是双向的，因此您只需要每对一次。

Answer 2

（1）使用igraph创建图表; （2）宣布为二分; （3）将其投影为单模式图。

el <- read.table(text = "Grant,Person
                         A,1
                         A,2
                         B,2
                         B,3", 
                  sep = ",", header = T, stringsAsFactors=F)
#1
net <- graph.edgelist(as.matrix(el))
#2
V(net)$type <- bipartite.mapping(net)$type

您可以通过检查来检查图表是否为二分图：

> net
IGRAPH DN-B 5 4 -- 
+ attr: name (v/c), type (v/l)
+ edges (vertex names):
[1] A->1 A->2 B->2 B->3

第二行中的“B”表示它是二分图。

#3
net1mode <- bipartite.projection(net)$proj2

bipartite.projection函数创建两个项目，每个模式一个。节点是第二个投影，因为它们位于原始边缘列表的第二列。

par(mfrow=c(1,2))
plot(net,edge.arrow.size=0.5,main="Two mode")
plot(net1mode,edge.arrow.size=0.5, main="One mode projection")