是否可以使用gfortran和openmpi在Linux中编译NASA并行基准(NPB)文件?

时间:2017-01-13 00:17:38

标签: linux compiler-errors mpi benchmarking gfortran

我正在尝试在我的RHEL7.3安装上运行NPB基准测试,但遇到与此处提出的问题类似的问题

Error while building NAS benchmarks

尝试制作BT基准测试,这是在fortran中,我收到以下错误:

cd BT; make NPROCS=16 CLASS=W SUBTYPE= VERSION=
make[1]: Entering directory '/mnt/npb_install/NPB3.3-MPI/BT'
make[2]: Entering directory '/mnt/npb_install/NPB3.3-MPI/sys'
make[2]: Nothing to be done for 'all'
make[2]: Leaving directory '/mnt/npb_install/NPB3.3-MPI/sys'
../sys/setparams bt 16 W
make[2]: Entering directory '/mnt/npb_install/NPB3.3-MPI/BT'
make[3]: Entering directory '/mnt/npb_install/NPB3.3-MPI/BT'
gfortran -O -o ../bin/bt.W.16 bt.o make_set.o initialize.o exact_solution.o exact_rhs.o set_constants.o adi.o define.o copy_faces.o rhs.o solve_subs.o x_solve.o y_solve.o z_solve.o add.o error.o verifiy.o setup_mpi.o ../common/print_results.o ../common/timers.o btio.o -L/usr/lib/openmpi-x84_64/ -lmpi
/bin/ld: cannot find -lmpi
collect2: error: ld returned 1 exit status
make[3]: *** [bt-bt] Error 1
make[3]: Leaving direc.......

然而,我不使用英特尔MPI,而是使用OpenMPI,但我并不完全理解其含义。

我的make.def文件具有以下mpi相关设置

#-------------------------------------
# This is the fortran compiler usedd for MPI programs
#-----------------------------------------
MPIF77 = gfortran
# This links MPI fortran programs; usually the same as ${MPIF77}
FLINK = ${MPIF77}

#------------------------------------------
# These macros are passed to the linker to help link with MPI correctly
#-------------------------------------------
FMPI_LIB = -L/usr/lib/openmpi/lib/ -lmpi

#-----------------------------------------
# These macros are passed to the compiler to help find 'mpif.h'
#------------------------------------------
FMPI_INC = -I/usr/include/openmpi-x86_64/

与上述问题中发布的相似。

从错误中,我假设输入参数-lmpi在编译时不是gfortran的有效输入参数,但是删除它会导致屏幕上出现未定义的引用,如:

 file.f:(.text+0x123): undefined reference to 'mpi_whatever_'

是否可以使用gfortran编译NPB?或者我明显在这里做错了什么? 我已经看到使用ifort是另一种选择,但我认为在提出可能的解决方案之前我会问这个问题

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

在黑客入侵之后,我通过以下修复解决了这个问题,不确定是什么做的。

OpenMPI可能没有正确安装(无法调用mpicc或其他包装器/ comps),修复它我运行了以下命令

{{1}}

更可能的解决方法是将make.def文件中的 gfortran 更改为 mpif77