我最近继承了一个基于特定PHP框架Asgard的项目构建。框架本身并不那么重要。
代码存储在GitHub上，包含框架文件，其中一些已修改，还有一些依赖项。在安装时，应该运行composer install，这将带来其余的依赖项。
大多数自定义代码分别位于public_html/modules和framework/Modules中的两个文件夹中。但是，有一些框架文件已被修改。
代码管理/安装过程对我来说似乎不合逻辑，我宁愿所有框架代码（指定版本的代码）都由composer引入，只有少数文件应用于顶部，如补丁。
是否有一些开发工作流程允许我向GitHub推送更改，而不是所有框架文件，然后在composer install运行时以某种方式在框架代码上应用补丁？
我知道作曲家是通过composer.json和composer.lock配置的，我只是不知道如何修补。
此外，我不知道如何在不包含初始框架文件的情况下仅将更改推送到Git，同时在我的工作文件夹中保留完整功能。
任何想法都会受到赞赏。
感谢。