是否有人知道是否可以派生R程序的文件名/文件路径?我正在寻找类似于"%sysfunc(GetOption(SYSIN))"在SAS中将返回SAS程序的文件路径(以批处理模式运行)。我可以在R做任何类似的事情吗?
到目前为止,我能够提出的最好的方法是使用我使用的文本编辑器(PSPad)中的快捷键添加文件名和当前目录。有更简单的方法吗?
这是我的榜样:
progname<-"Iris data listing"
# You must use either double-backslashes or forward slashes in pathnames
progdir<-"F:\\R Programming\\Word output\\"
# Set the working directory to the program location
setwd(progdir)
# Make the ReporteRs package available for creating Word output
library(ReporteRs)
# Load the "Iris" provided with R
data("iris")
options('ReporteRs-fontsize'=8, 'ReporteRs-default-font'='Arial')
# Initialize the Word output object
doc <- docx()
# Add a title
doc <- addTitle(doc,"A sample listing",level=1)
# Create a nicely formatted listing, style similar to Journal
listing<-vanilla.table(iris)
# Add the listing to the Word output
doc <- addFlexTable(doc, listing)
# Create the Word output file
writeDoc( doc, file = paste0(progdir,progname,".docx"))
这在批处理和RStudio中都运行良好。我真的很欣赏一个更好的解决方案
答案 0 :(得分:1)
@Juan Bosco提供的Rscript: Determine path of the executing script链接包含了我需要的大部分信息。它没有解决的一个问题是在RStudio中运行R程序(在RStudio中采购并进行了讨论和解决)。我发现可以使用rstudioapi::getActiveDocumentContext()$path)
处理此问题。
还值得注意的是,批处理模式的解决方案无法使用
Rterm.exe --no-restore --no-save < %1 > %1.out 2>&1
解决方案要求使用--file=
选项,例如
D:\R\R-3.3.2\bin\x64\Rterm.exe --no-restore --no-save --file="%~1.R" > "%~1.out" 2>&1 R_LIBS=D:/R/library
以下是@aprstar发布的get_script_path
函数的新版本。这已被修改为也适用于RStudio(请注意,它需要rstudioapi
库。
# Based on "get_script_path" function by aprstar, Aug 14 '15 at 18:46
# https://stackoverflow.com/questions/1815606/rscript-determine-path-of-the-executing-script
# That solution didn't work for programs executed directly in RStudio
# Requires the rstudioapi package
# Assumes programs executed in batch have used the "--file=" option
GetProgramPath <- function() {
cmdArgs = commandArgs(trailingOnly = FALSE)
needle = "--file="
match = grep(needle, cmdArgs)
if (cmdArgs[1] == "RStudio") {
# An interactive session in RStudio
# Requires rstudioapi::getActiveDocumentContext
return(normalizePath(rstudioapi::getActiveDocumentContext()$path))
}
else if (length(match) > 0) {
# Batch mode using Rscript or rterm.exe with the "--file=" option
return(normalizePath(sub(needle, "", cmdArgs[match])))
}
else {
ls_vars = ls(sys.frames()[[1]])
if ("fileName" %in% ls_vars) {
# Source'd via RStudio
return(normalizePath(sys.frames()[[1]]$fileName))
}
else {
# Source'd via R console
return(normalizePath(sys.frames()[[1]]$ofile))
}
}
}
我把它放在我的.Rprofile
文件中。现在,我可以使用以下代码以批处理模式或RStudio中获取文件信息。我没有尝试使用source()
,但这也应该有用。
# "GetProgramPath()" returns the full path name of the file being executed
progpath<-GetProgramPath()
# Get the filename without the ".R" extension
progname<-tools::file_path_sans_ext(basename(progpath))
# Get the file directory
progdir<-dirname(progpath)
# Set the working directory to the program location
setwd(progdir)