如何将参数作为数字向量读取

Question

我的R脚本遇到了一些麻烦，因为我想从bash脚本中使用它。当我调用脚本并引入其参数时，我的问题出现了，我使用以下命令行

Rscript myscript.R 1,2,1,3,2,3

我想使用参数＆＃34; 1,2,1,3,2,3＆＃34;作为数字向量，以便使用其长度和元素。所以在myscript.R中代码是：

args <- commandArgs(trailingOnly=TRUE)
comparisons <- args[1]

但是当我将这个变量comparisons用于其他事情时，会出现错误：

for (i in seq(from = 1, to = length(comparisons)-1, by = 2))
{
...
}

错误讯息：

Error in seq.default(from = 1, to = (length(comparisons) - 1), by = 2) : 
wrong sign in 'by' argument
Calls: seq -> seq.default
Execution halted

如何将参数comparisons读作数字向量？

Answer 1

scan()函数是一个经常被忽视但非常有用且功能多样的工具：

scan(text=args[1], sep=",", quiet=TRUE)

如果您不需要double s，那么：

scan(text=args[1], what=integer(), sep=",", quiet=TRUE)

会给你整数。

Answer 2

使用您的代码，比较只是一个单元素的字符串向量，因此(length(comparisons) - 1) = 0。这导致from 1 -> to 0正在减少，但by 2为正，因此seq失败。

您可以使用此代码将其转换为数字向量

comparisons <- unlist(lapply(strsplit(comparisons, ","), as.numeric))