Question

今天早上我升级了我的gfortran（从4.7到6.1.0）和OpenMPI（从1.10到2.0.1）编译器。我写了这个简单的程序：

./a.out

当我直接编译（没有mpirun，只是[username:79762] mca_base_component_repository_open: unable to open mca_grpcomm_bad: dlopen(/usr/local/lib/openmpi/mca_grpcomm_bad.so, 9): Symbol not found: _orte_grpcomm_base_modex Referenced from: /usr/local/lib/openmpi/mca_grpcomm_bad.so Expected in: flat namespace in /usr/local/lib/openmpi/mca_grpcomm_bad.so (ignored) [username:79761] mca_base_component_repository_open: unable to open mca_grpcomm_bad: dlopen(/usr/local/lib/openmpi/mca_grpcomm_bad.so, 9): Symbol not found: _orte_grpcomm_base_modex Referenced from: /usr/local/lib/openmpi/mca_grpcomm_bad.so Expected in: flat namespace in /usr/local/lib/openmpi/mca_grpcomm_bad.so (ignored) [username:79761] mca_base_component_repository_open: unable to open mca_pml_bfo: dlopen(/usr/local/lib/openmpi/mca_pml_bfo.so, 9): Symbol not found: _ompi_free_list_item_t_class Referenced from: /usr/local/lib/openmpi/mca_pml_bfo.so Expected in: flat namespace in /usr/local/lib/openmpi/mca_pml_bfo.so (ignored) [username:79761] mca_base_component_repository_open: coll "/usr/local/lib/openmpi/mca_coll_hierarch" uses an MCA interface that is not recognized (component MCA v2.0.0 != supported MCA v2.1.0) -- ignored [username:79761] mca_base_component_repository_open: unable to open mca_coll_ml: dlopen(/usr/local/lib/openmpi/mca_coll_ml.so, 9): Symbol not found: _mca_bcol_base_components_in_use Referenced from: /usr/local/lib/openmpi/mca_coll_ml.so Expected in: flat namespace in /usr/local/lib/openmpi/mca_coll_ml.so (ignored)）时，我收到以下消息（因为程序按预期运行，它们并不是真正的错误）：

print'(3(A,I1))', "OpenMPI version = ", OMPI_MAJOR_VERSION, ".", OMPI_MINOR_VERSION, ".",& 
  8                       OMPI_RELEASE_VERSION

我记得在使用openmpi编写代码并使用mpich或intel版本的mpirun运行代码时会收到类似的警告。现在显然情况并非如此，但我想我已经提到过了。

知道导致这些警告的原因吗？

修改

为了确保我的运行时OpenMPI库确实是2.0.1，我将这行代码添加到上面显示的代码中：

OpenMPI version = 2.0.1

给出了以下输出：

mpirun -v

根据VladimirF的建议，我跑了[username:02210] mca_base_component_repository_open: unable to open mca_grpcomm_bad: dlopen(/usr/local/lib/openmpi/mca_grpcomm_bad.so, 9): Symbol not found: _orte_grpcomm_base_modex Referenced from: /usr/local/lib/openmpi/mca_grpcomm_bad.so Expected in: flat namespace in /usr/local/lib/openmpi/mca_grpcomm_bad.so (ignored) -------------------------------------------------------------------------- No executable was specified on the mpirun command line. Aborting.，输出了以下内容：

mpirun --version

此外，mpirun (Open MPI) 2.0.1会返回：{{1}}

Answer 1

感谢Gilles Gouaillardet在OpenMPI论坛上的帮助，我已经找到了问题。

<强>问题：

我安装了较新版本的2.0.1而没有卸载1.10。由于我在同一位置安装了它，因此一些mca文件被覆盖而其他mca文件已被删除或在较新版本中重命名，因此仍然存在于目录中。最后，版本2.0.1无法识别这些模块文件，导致出现上述警告。

<强>解决方案：

删除所有插件文件：rm -rf /usr/local/lib/openmpi
重新安装Openmpi：make install

openmpi忽略错误：无法识别mca接口

1 个答案: