如何替换R中列的内容？

Question

我有一个包含以下数据的文件，我正在尝试更改列＆＃34; condition＆＃34;包括＆＃34; GBM1，GBM10 ......＆＃34;通常的名称只是＆＃34; GBM＆＃34;。 我需要R命令的帮助才能将它们转换为GBM。 我想知道如何使用dplyr来点缀它。

以下是数据..

dat <- data.frame(
 sample = c("GSM564972", "GSM564973", "GSM564974"),
 condition= c("GBM1", "GBM10", "GBM11"))

期望的输出：

   sample condition
GSM564972       GBM
GSM564973       GBM
GSM564974       GBM

Answer 1

以下是str_extract

的选项

library(stringr)
library(dplyr)
dat %>%
     mutate(condition = str_extract(condition, "\\D+"))

Answer 2

您可以使用sub功能将数字替换为＆＃34;＆＃34; （空字符串）与mutate包中的dplyr结合使用。

library(dplyr)
# use sub within mutate to change column
mutate(dat, condition = sub("\\d+", "", condition))

有关sub用法的示例，请参阅here。