Question

现在整个世界都在努力使用SSL（这个决定很有意义）我们中的一些人使用github和相关服务来存储csv文件有一点挑战。从URL读取时，read.csv（）函数不支持SSL。为了解决这个问题，我正在做一个小舞蹈，我喜欢称之为SSL歌舞伎舞蹈。我用RCurl抓取文本文件，将其写入临时文件，然后用read.csv（）读取它。这样做有更顺畅的方法吗？更好的解决方法？

以下是SSL歌舞伎的一个简单示例：

require(RCurl)
myCsv <- getURL("https://gist.github.com/raw/667867/c47ec2d72801cfd84c6320e1fe37055ffe600c87/test.csv")
temporaryFile <- tempfile()
con <- file(temporaryFile, open = "w")
cat(myCsv, file = con) 
close(con)

read.csv(temporaryFile)

Answer 1

无需将其写入文件 - 只需使用textConnection（）

即可

require(RCurl)
myCsv <- getURL("https://gist.github.com/raw/667867/c47ec2d72801cfd84c6320e1fe37055ffe600c87/test.csv")
WhatJDwants <- read.csv(textConnection(myCsv))

Answer 2

使用Dirk的建议来探索method=""导致这种更简洁的方法，不依赖于外部RCurl包。

temporaryFile <- tempfile()
download.file("https://gist.github.com/raw/667867/c47ec2d72801cfd84c6320e1fe37055ffe600c87/test.csv",destfile=temporaryFile, method="curl")
read.csv(temporaryFile)

但似乎我不能只设置options("download.file.method"="curl")

Answer 3

是 - 请参阅help(download.file)及其所有堂兄指出的read.csv()。 method=参数有：

method用于下载文件的方法。目前可以使用下载方法“internal”，“wget”，“curl”和“lynx”，并且有一个值“auto”：参见“Details”。该方法也可以通过选项“download.file.method”进行设置：参见options（）。

然后您将此选项用于options()：

download.file.method: 用于download.file的方法。目前可以使用下载方法“内部”，“wget”和“lynx”。当选择method =“auto”时，此选项没有默认值：请参阅download.file。

转到外部程序 curl，而不是RCurl包。

编辑：看起来我是半右半错。 read.csv()等不使用所选方法，需要手动使用download.file()（然后使用curl或其他选定方法）。使用download.file()的其他功能（例如包安装或更新）将从设置选项中获益，但对于JD关于通过https的csv文件的初始查询，在{{1}之前需要显式的download.file()已下载的文件。

Answer 4

R core应该将R连接作为C API打开。我过去曾提出过这个问题：

https://stat.ethz.ch/pipermail/r-devel/2006-October/043056.html

没有回应。

Answer 5

鉴于这个问题出现了很多，我一直致力于一个无缝处理HTTPS / SSL数据的软件包。该软件包名为 rio 。它的一个版本在CRAN上，但现在支持此is only available on GitHub的最新版本。安装软件包后，您可以在一行中读取数据：

# install and load rio
library("devtools")
install_github("leeper/rio")
library("rio")

# import
import("https://gist.github.com/raw/667867/c47ec2d72801cfd84c6320e1fe37055ffe600c87/test.csv")
##   a b
## 1 1 2
## 2 2 3
## 3 3 4
## 4 4 5

基本上，import处理手动下载（使用curl），然后从文件扩展名中推断文件格式，从而创建数据帧而无需知道要使用的功能或如何下载它。

Answer 6

我发现由于Dropbox改变了他们使用https：//提供链接的方式，因此以上解决方案都不再有效。幸运的是，我不是第一个发现这个发现的人，Christopher Gandrud在r-bloggers上发布了一个解决方案：

http://www.r-bloggers.com/dropbox-r-data/

在安装repmis软件包及其依赖项之后，这种方法对我有用。

用R读取ssl上的csv文件

6 个答案: