我有一个名为counts
的数据框,如下所示:
Mark Helen
A 12 1
B 3 56
C 8 9
我使用不同的函数为数据框的每一列分配一个组索引:
ind <- factor(c("MALE","FEMALE"))
result <- function(counts,ind)
每次我有一个不同的数据帧,而不是在我的R脚本中手动编辑ind <- factor(c("MALE","FEMALE"))
命令,为了获得一些时间,我试图从命令行传递矢量组件。
我正在使用的命令行:
R -f my_script.R --args "MALE","FEMALE"
其中my_script.R
是:
arg <- commandArgs(trailingOnly = TRUE)
ind <- factor(c(unlist(strsplit(path[1],","))))
result <- function(counts,ind)
虽然我得到了相同的ind
值,但是我是手动编辑脚本还是从命令行传递参数:
> ind
[1] MALE FEMALE
Levels: MALE FEMALE
> ind[1]
[1] MALE
Levels: MALE FEMALE
> ind[2]
[1] FEMALE
Levels: MALE FEMALE
> length(ind)
[1] 2
> ncol(counts)
[1] 2
只有在我使用命令行中的参数时才会出现此错误:
> result <- function(counts,ind)
length(ind) == ncol(counts) is not TRUE
任何想法,我怎么能正确传递字符串参数?