我在下面的代码中使用了使用Scala的Apache Spark-GraphFrames,我在上面的代码中应用BFS并尝试找到Vertice 0到100之间的距离。
import org.apache.spark._
import org.graphframes._
import org.graphframes.GraphFrame
import org.apache.spark.sql.DataFrame
import org.apache.spark.sql.SQLContext
object SimpApp{
def main(args: Array[String]) {
val conf = new SparkConf().setAppName("SimpApp")
val sc = new SparkContext(conf)
val sqlContext = new SQLContext(sc)
val nodesList = sqlContext.read.format("com.databricks.spark.csv").option("header", "true").option("inferSchema", "true").load("CSV File Path")
val edgesList= sqlContext.read.format("com.databricks.spark.csv").option("header", "true").option("inferSchema", "true").load("CSV File Path")
val v=nodesList.toDF("id")
val e=edgesList.toDF("src", "dst", "dist")
val g = GraphFrame(v, e)
var paths: DataFrame = g.bfs.fromExpr("id = 0").toExpr(s"id = 100").maxPathLength(101).run()
paths.show()
sc.stop()
}
}
Soucre节点:0目标节点:100
顶点列表如下所示
id
0
1
2
3
.
.
.
up to
1000
这是边缘列表
src dst dist
0 1 2
1, 2, 1
2, 3, 5
3, 4, 1
4, 5, 3
5, 6, 3
6, 7, 6
. . .
. . .
. . .
up to
999, 998, 4
但是上面给出的代码问题是,它需要花费大量时间才能执行0到100个顶点,因为它运行了4个小时但没有输出。 上面的代码我运行在具有12 GB RAM的单机上。
请指导我加快和优化代码。
答案 0 :(得分:3)
要验证,我认为你试图找到图表未加权边缘的最短距离,因此使用BFS。在这种情况下,您可能希望从查询中删除maxPathLength(101)
,以便:
g.bfs.fromExpr("id = 0").toExpr("id = 100").run()
如BFS definition中所述:
maxPathLength
是默认值为的路径长度限制 10.如果找不到长度< = maxPathLength的有效路径,则终止BFS。
通过在顶点0和顶点100之间指定101,它将尝试查找从0到100的任何和所有边长度为101的边,因此迭代次数很多。
BFS的有趣示例和最短距离可以在关于航班的经典图表场景中描述(参考:On-Time Flight Performance with GraphFrames for Apache Spark),其中顶点(或节点)是机场,而边缘是这些机场之间的航班。
如果您正试图在SFO
(旧金山)和BUF
(布法罗)之间寻找直飞航班,则BFS查询将是:
tripGraph.bfs.fromExpr("id = 'SFO'").toExpr("id = 'BUF').maxPathLength(1).run
如引用的链接中所述,没有直接航班,因此没有结果。但是,如果您将maxPathLength
增加到2(即SFO
和BUF
个节点之间的一个额外节点),那么您会找到许多路径(例如SFO
> BOS
> BUF
或旧金山到波士顿到布法罗)
tripGraph.bfs.fromExpr("id = 'SFO'").toExpr("id = 'BUF').maxPathLength(2).run