我有这个简单的脚本,其中大部分代码都是由Martin Morgan从this answer中提取的:
#!/usr/bin/Rscript
# sript name: testclass.R
# library(methods)
.A1 <- setClass("A1", representation(a="integer"))
.B1 <- setClass("B1", contains="A1", representation(b="integer"))
A1 <- function(a = integer(), ...) {
.A1(a=a, ...)
}
B1 <- function(a=integer(), b=integer(), ...) {
.B1(A1(a), b=b, ...)
}
b <- .B1()
inherits(b, "A1")
如果我使用Rscript运行脚本,则会产生此错误:
user@localhost ~/test
% chmod +x testclass.R
user@localhost ~/test
% ./testclass.R
Error: could not find function "setClass"
Execution halted
如果我取消注释行library(methods)
并再次运行,则可以正常运行:
user@localhost ~/test
% ./testclass.R
[1] TRUE
或者如果我这样运行,我也不需要手动导入methods
:
R --vanilla <testclass.R
所以我的问题是,发生了什么,以及如何避免手动导入methods
并成功运行Rscript?
R版本:
Rscript --version
R scripting front-end version 3.3.1 (2016-06-21)
R --version
R version 3.3.1 (2016-06-21) -- "Bug in Your Hair"
Copyright (C) 2016 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
更新
在等待更具信息性的答案时作为一种解决方法:我可以使用/usr/bin/r
包中的littler
代替/usr/bin/Rscript
,但错误不会发生。
答案 0 :(得分:1)
方法包总是附带R,但由于并不总是需要Rscript默认选择不加载它。 ?Rscript
会告诉您这是为了节省启动时间。 Rstudio和R默认加载此库。如果要在要使用Rscript运行的程序中使用方法包中的函数,那么简单的解决方案是添加以下行:
library(methods)
脚本中的。这在通过Rstudio或R运行时没有坏处,因为方法包已经在那里加载了。我经常将library(methods)
添加到我知道将使用Rscript运行的所有脚本中。