Question

bamtools包中的一个头文件，例如BamReader.h，安装在

/usr/local/include/bamtools/api

我试图将include标志设置为：

CXXFLAGS="$CXXFLAGS -I/usr/local/include/bamtools"
or
CXXFLAGS="$CXXFLAGS -I/usr/local/include/bamtools/api"
AC_CHECK_HEADERS([BamReader.h], [bamtools_found=yes], [AC_MSG_ERROR([Unable to find bambools header])])

如果我检查config.log文件，第一个给了我一个错误：

configure:3837: g++ -c -g -O2 -I/usr/local/include/bamtools  conftest.cpp >&5
conftest.cpp:54:23: fatal error: BamReader.h: No such file or directory
compilation terminated.

第二个给了我以下错误：

configure:3837: g++ -c -g -O2 -I/usr/local/include/bamtools/api  conftest.cpp >&5
In file included from conftest.cpp:54:0:
/usr/local/include/bamtools/api/BamReader.h:13:28: fatal error: api/api_global.h: No such file or directory
 #include "api/api_global.h"^M
                            ^
compilation terminated.
configure:3837: $? = 1

问题在于BamReader.h试图包含api / api_global.h

Answer 1

我通过将api放入它工作的AC_CHECK_HEADERS中得到了一个简单的修复。

CXXFLAGS="$CXXFLAGS -I/usr/local/include/bamtools"
AC_CHECK_HEADERS([api/BamReader.h], [bamtools_found=yes], [AC_MSG_ERROR([Unable to find bambools header])])

configure output
checking api/BamReader.h usability... yes

基本上，您必须通过将api /附加到每个标头来使用该库。请评论：这是一个好习惯吗？

如果标头安装路径中包含api，则AC_CHECK_HEADER会失败

1 个答案: