Question

我正在运行一个使用 RMySQL 包连接到 MySQL数据库的R程序，一切运行良好。但现在我想通过 RSCRIPT 运行相同的程序，并希望传递连接参数，就像这样

config.xml

但它不起作用，我收到一条消息：

＆＃34;错误（函数（classes，fdef，mtable）：无法找到用于签名的函数'dbConnect'的继承方法 “＆＃34;字符＆＃34;”＆＃34;

我该怎么办？

Answer 1

如错误消息所示，您尝试通过向其传递字符向量来连接到数据库。那不会起作用。

一种选择是在脚本中使用正确的语法：

library(RMySQL)
mysqlconnection <- dbConnect(RMySQL::MySQL(),
                            user = 'root',
                            password = '',
                            dbname = 'nepal_statgri',
                            host = 'localhost')

但是，你提到使用Rscript。所以我的理解是，你有兴趣拥有一个不存储连接细节的R文件，而是想要从shell终端传递这些细节作为参数。

执行此操作的一个选项是使用允许您轻松为R脚本创建命令行界面的程序包docopt。例如，如果将以下内容保存在名为connect_mysql.R的文件中：

'usage: connect_mysql.R [--user <user> --password <pwd> --db <database> --host <host>]

options:
  --user username
  --password password
  --db database
  --host host
' -> doc

library(docopt)
library(RMySQL)

opts <- docopt(doc)

con <- dbConnect(RMySQL::MySQL(),
          username = opts$user,
          password = opts$password,
          dbname  = opts$db,
          host  = opts$host)
dbListTables(con)
dbDisconnect(con)

然后您可以使用Rscript调用它并传递您的连接详细信息：

Rscript connect_mysql.R --user root --password password --db nepal_statgri --host localhost

R Mysql dbconnect参数

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