我最近发现你可以巧妙地使用R-markdown(.Rmd)文件。因为我更喜欢在Sublime文本2中完成所有工作,所以我很高兴找到这个package。由于这个post,发送到R的工作很好,但由于某些原因,sublime并没有编译我的markdown文件。在strg + shift + b而不是.md文件之后我得到了这个错误:
Traceback (most recent call last):
File ".\sublime_plugin.py", line 337, in run_
File ".\exec.py", line 154, in run
TypeError: __init__() got an unexpected keyword argument 'shell_cmd'
测试文件具有此表单
% Test document
Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipisicing elit, sed do `eiusmod` tempor incididunt ut labore et dolore magna aliqua. Ut enim ad minim veniam, quis nostrud exercitation ullamco laboris nisi ut aliquip ex ea commodo.
```{r example_chunk, fig.width=5, fig.height=3}
x <- rnorm(100)
y <- rnorm(100)
plot(y ~ x, pch=20)
```
我使用python 2.7。并安装了knitr的所有依赖项。
答案 0 :(得分:0)
该软件包中的构建系统包含一个与Sublime Text 2不兼容的Run
变体,这是导致您的问题的原因。这似乎是包装作者的疏忽,因此提交错误报告可能是值得的。
与此同时,您可以通过修改构建文件来自行解决问题。如果您打开Packages\SublimeKnitr\knitr-Markdown.sublime-build
(如果您没有手动安装插件,请使用PackageResourceViewer),您会看到以下内容:
{
"selector": "text.html.markdown.knitr",
"working_dir": "${project_path:${folder}}",
"env": { "LANG": "en_US.UTF-8" },
"cmd": [ "Rscript -e \"library(knitr); knit('$file', output='$file_path/$file_base_name.md')\"" ],
"shell": true,
"variants":
[
{
"name": "Run",
"working_dir": "$file_path",
"shell_cmd": "Rscript -e \"rmarkdown::render(input = '$file')\""
}
]
}
问题在于Sublime Text 2不支持shell_cmd
(这似乎是Sublime Text 3的补充)。主构建使用cmd
并将shell
设置为true以运行shell,这是在Sublime Text 2中进行此操作的正确方法。
如果您通过将shell_cmd
更改为cmd
并将字符串参数包装在方括号中并包含shell行来修改变体:
"cmd": [ "Rscript -e \"rmarkdown::render(input = '$file')\"" ],
"shell": true
它应该适合你。请注意,构建文件是JSON,因此以逗号分隔所有内容非常重要。
此处可能不需要添加"shell": true
部分。它可能会在构建的早期保留。我不熟悉Sublime Text 2如何处理它。