在LINUX上使用C ++进行LAPACK / LAPACKE ---编译,链接和运行?

时间:2016-12-05 18:17:41

标签: c++ linux compilation lapack lapacke

说明: 我开发了一个使用LAPACK(LAPACKE)和MPI的C ++应用程序,所有这些都在Windows上。在Windows中正常工作(编译和链接通过Code :: Blocks IDE处理),但执行速度太慢。因此,我想将代码迁移到运行在CentOS Linux下的小型“超级计算机”,我们已经安装了GNU C ++,MPICH2和LAPACK。

问题: 如何在Linux / CentOS上调用/链接和运行调用LAPACKE的C ++代码?我是否必须在CentOS机器上安装GNU Fortran才能使用LAPACK(LAPACKE)编译/链接/运行C ++?

感谢很多!!!

1 个答案:

答案 0 :(得分:3)

我认为我的Debian与你的CentOS足够接近,可以让这些技巧发挥作用......

1)检查计算机上是否安装了LAPACKE。

  • 您可以搜索文件/usr/include/usr/local/includelapacke.hlapacke_config.hlapacke_mangling.hlapacke_mangling_with_flags.hlapacke_utils.h等位置
  • 您可以针对静态库/usr/lib或动态库/usr/local/liblapacke.a搜索lapacke.solapacke.so.3等位置。

如果缺少这些文件,请考虑安装软件包liblapackeliblapacke-dev。或者,(特别是如果你没有root权限),你可以在http://www.netlib.org/lapack/#_lapack_version_3_6_1下载netlib的lapack和lapacke的源代码来编译LAPACKE,将make.inc.example重命名为make.inc,然后输入:

    make
    make lapackelib

包含文件位于lapack-3.6.1/LAPACKE/include,图书馆将位于lapack-3.6.1gccgfortran可用于从头开始重新编译lapack和lapacke。

2)让我们根据this example编译一个简单的代码:

#include <iostream>
#include <string>
#include <fstream>

#include <stdlib.h>
#include <stdio.h>
#include <math.h>

#include <lapacke.h>
#include "mpi.h"

void print_matrix_rowmajor(const char* desc, lapack_int m, lapack_int n, double* a, lapack_int lda );

int main(int argc, char *argv[])
{
    MPI_Init(&argc,&argv);
    std::cout << "Start..." << std::endl;
    //std::string fn_VALS;

    /* Locals */
    double A[5][3] = {1,1,1,2,3,4,3,5,2,4,2,5,5,4,3};
    double b[5][2] = {-10,-3,12,14,14,12,16,16,18,16};
    lapack_int info,m,n,lda,ldb,nrhs;

    /* Initialization */
    m = 5;
    n = 3;
    nrhs = 2;
    lda = 3;
    ldb = 2;

    /* Print Entry Matrix */
    print_matrix_rowmajor( "Entry Matrix A", m, n, *A, lda );
    /* Print Right Rand Side */
    print_matrix_rowmajor( "Right Hand Side b", n, nrhs, *b, ldb );
    printf( "\n" );
    /* Executable statements */
    printf( "LAPACKE_dgels (row-major, high-level) Example Program Results\n" );
    /* Solve least squares problem*/
    info = LAPACKE_dgels(LAPACK_ROW_MAJOR,'N',m,n,nrhs,*A,lda,*b,ldb);

    /* Print Solution */
    print_matrix_rowmajor( "Solution", n, nrhs, *b, ldb );
    printf( "\n" );


    std::cout << "info = " << info << std::endl;




    std::cout << "Done :-) !!!" <<std::endl;
    MPI_Finalize();
    return 0;
}


////////////////////////////////////////////////////////* Auxiliary routine: printing a matrix */
void print_matrix_rowmajor(const char* desc, lapack_int m, lapack_int n, double* a, lapack_int lda )
{
    lapack_int i, j;
    printf( "\n %s\n", desc );
    for( i = 0; i < m; i++ )
    {
        for( j = 0; j < n; j++ )
        {
            printf( " %6.2f", a[i*lda+j]);
        }
        printf( "\n" );
    }
}
//=======================================

编译命令是:

mpiCC main.cpp -o main -llapacke -llapack -lblas -lm -Wall

如果包含文件位于特定文件夹中,请使用-I/usr/pathtolapackedoth。同样,如果库位于特定文件夹中,请尝试-L/usr/lib/pathtoliblapackedota。 根据MPICH2的安装方式,mpiCC可能包含g ++。您可以输入mpiCC --version了解详情。使用2个进程运行它:

mpirun -np 2 main

最后,您不必在CentOS机器上安装GNU Fortran,以便使用LAPACK(LAPACKE)编译/链接/运行C ++。实际上,只有在您希望从头开始重新编译LAPACK时才需要它。