我是purrr
范例的新手,并且正在努力解决这个问题。
遵循一些资源我已经设法嵌套数据框,在嵌套数据上运行线性模型,从每个lm中提取一些系数,并为每个lm生成摘要。我要做的最后一件事是提取" r.squared"从摘要(我原本认为这将是我试图实现的最简单的部分),但无论出于何种原因,我都无法正确理解语法。
这是我的工作的MWE:
library(purrr)
library(dplyr)
library(tidyr)
mtcars %>%
nest(-cyl) %>%
mutate(fit = map(data, ~lm(mpg ~ wt, data = .)),
sum = map(fit, ~summary))
这是我尝试提取失败的r.squared:
mtcars %>%
nest(-cyl) %>%
mutate(fit = map(data, ~lm(mpg ~ wt, data = .)),
sum = map(fit, ~summary),
rsq = map_dbl(sum, "r.squared"))
Error in eval(substitute(expr), envir, enclos) : `x` must be a vector (not a closure)
这表面上类似于RStudio网站上提供的示例:
mtcars %>%
split(.$cyl) %>%
map(~ lm(mpg ~ wt, data = .x)) %>%
map(summary) %>%
map_dbl("r.squared")
这有效但我希望r.squared值位于一个新列(因此是mutate语句)中,我想了解为什么我的代码不工作而不是解决方法问题
编辑:
这是我使用以下解决方案的工作解决方案:
mtcars %>%
nest(-cyl) %>%
mutate(fit = map(data, ~lm(mpg ~ wt, data = .)),
summary = map(fit, glance),
r_sq = map_dbl(summary, "r.squared"))
编辑2:
因此,事实证明该错误来自于summary = map(fit,〜summary)行中包含波形符号键。我的猜测是,使对象成为嵌套的函数,而不是摘要本身返回的对象。如果有人想要加入,我会喜欢这方面的权威答案。
要明确的是,此版本的原始代码可以正常工作:
mtcars %>%
nest(-cyl) %>%
mutate(fit = map(data, ~lm(mpg ~ wt, data = .)),
summary = map(fit, summary),
r_sq = map_dbl(summary, "r.squared"))
答案 0 :(得分:5)
要适应当前的管道,您需要使用.select2-selection__arrow {
display: none
}
以及unnest
包中的map
和glance
。
broom
你将获得的不仅仅是r平方,从那里你可以使用library(tidyr)
library(dplyr)
library(broom)
mtcars %>%
nest(-cyl) %>%
mutate(fit = map(data, ~lm(mpg ~ wt, data = .))) %>%
unnest(map(fit, glance))
删除你不需要的东西。
如果要保持嵌套在列表列中的模型摘要:
select
如果您只想从嵌套框架中提取单个值,您只需要使用mtcars %>%
nest(-cyl) %>%
mutate(fit = map(data, ~lm(mpg ~ wt, data = .)),
summary = map(fit, glance))
到实际值(而不是我最初建议的map
或[[
,很多谢谢你找到了。)
extract2
答案 1 :(得分:4)
我认为,对于您希望实现的目标,最好使用glance()
包中的broom
函数:
library(broom)
library(dplyr)
mtcars %>%
group_by(cyl) %>%
do(glance(lm(mpg ~ wt, data = .))) %>%
select(cyl, r.squared)
# cyl r.squared
# <dbl> <dbl>
#1 4 0.5086326
#2 6 0.4645102
#3 8 0.4229655
答案 2 :(得分:1)
必须有一个更好的方法,这是我的管道尝试:
mtcars %>%
split(.$cyl) %>%
map(~ lm(mpg ~ wt, data = .x)) %>%
map(summary) %>%
map_dbl("r.squared") %>%
list() %>%
as.data.frame(col.names = "r.squared") %>%
add_rownames(var = "cyl")
# # A tibble: 3 × 2
# cyl r.squared
# <chr> <dbl>
# 1 4 0.5086326
# 2 6 0.4645102
# 3 8 0.4229655
注意:您可能会收到警告。
警告消息:已弃用,请改用tibble :: rownames_to_column()。