Intelij，启动生成的JAR文件，其中包含另一个JAR文件会导致SecurityException

Question

我使用Intellij IDEA 15创建了gradle java项目：

然后在我的build.gradle我已将这行代码添加到dependencies以便使用其他JAR文件

 compile fileTree(dir: 'libs', include: '*.jar')

然后我打开Artifcats设置并使用Main类设置我的Manifest File位置：

My Manifest文件包含以下内容：

Manifest-Version: 1.0
Main-Class: kz.ant.signer.Main

我的主要课程在我的Hello world方法

中有简单的private static main功能

然后我生成我的JAR文件并尝试通过控制台启动它。它向我显示了这条消息：

no main manifest attribute, in signer.jar

然后我用archiver打开这个JAR文件并手动编写我的Main类以启动它。

然后它向我抛出了这个错误：

Error: A JNI error has occurred, please check your installation and try again
Exception in thread "main" java.lang.SecurityException: Invalid signature file digest for Manifest main attributes
    at sun.security.util.SignatureFileVerifier.processImpl(Unknown Source)
    at sun.security.util.SignatureFileVerifier.process(Unknown Source)
    at java.util.jar.JarVerifier.processEntry(Unknown Source)
    at java.util.jar.JarVerifier.update(Unknown Source)
    at java.util.jar.JarFile.initializeVerifier(Unknown Source)
    at java.util.jar.JarFile.getInputStream(Unknown Source)
    at sun.misc.URLClassPath$JarLoader$2.getInputStream(Unknown Source)
    at sun.misc.Resource.cachedInputStream(Unknown Source)
    at sun.misc.Resource.getByteBuffer(Unknown Source)
    at java.net.URLClassLoader.defineClass(Unknown Source)
    at java.net.URLClassLoader.access$100(Unknown Source)
    at java.net.URLClassLoader$1.run(Unknown Source)
    at java.net.URLClassLoader$1.run(Unknown Source)
    at java.security.AccessController.doPrivileged(Native Method)
    at java.net.URLClassLoader.findClass(Unknown Source)
    at java.lang.ClassLoader.loadClass(Unknown Source)
    at sun.misc.Launcher$AppClassLoader.loadClass(Unknown Source)
    at java.lang.ClassLoader.loadClass(Unknown Source)
    at sun.launcher.LauncherHelper.checkAndLoadMain(Unknown Source)

我认为这是因为Manifest文件夹中有*.RSA和*.DSA个文件，所以我在build.gradle中添加了这些代码行：

jar {
   doFirst {
    from { configurations.compile.collect { it.isDirectory() ? it : zipTree(it) } }
    }
   exclude 'META-INF/*.RSA', 'META-INF/*.SF','META-INF/*.DSA'
}

然而，这并没有改变任何事情。还有这些签名文件。

请问解决这个问题？