将CSV读入带有时间戳和日期类型的Spark Dataframe

时间:2016-11-30 00:27:19

标签: apache-spark apache-spark-sql apache-spark-1.6

这是CDH,Spark 1.6

我正在尝试将此假设CSV导入apache Spark DataFrame:

$ hadoop fs -cat test.csv
a,b,c,2016-09-09,a,2016-11-11 09:09:09.0,a
a,b,c,2016-09-10,a,2016-11-11 09:09:10.0,a

我使用 databricks-csv jar。

val textData = sqlContext.read
    .format("com.databricks.spark.csv")
    .option("header", "false")
    .option("delimiter", ",")
    .option("dateFormat", "yyyy-MM-dd HH:mm:ss")
    .option("inferSchema", "true")
    .option("nullValue", "null")
    .load("test.csv")

我使用inferSchema为生成的DataFrame制作架构。 printSchema()函数为上面的代码提供了以下输出:

scala> textData.printSchema()
root
 |-- C0: string (nullable = true)
 |-- C1: string (nullable = true)
 |-- C2: string (nullable = true)
 |-- C3: string (nullable = true)
 |-- C4: string (nullable = true)
 |-- C5: timestamp (nullable = true)
 |-- C6: string (nullable = true)

scala> textData.show()
+---+---+---+----------+---+--------------------+---+
| C0| C1| C2|        C3| C4|                  C5| C6|
+---+---+---+----------+---+--------------------+---+
|  a|  b|  c|2016-09-09|  a|2016-11-11 09:09:...|  a|
|  a|  b|  c|2016-09-10|  a|2016-11-11 09:09:...|  a|
+---+---+---+----------+---+--------------------+---+

C3列具有字符串类型。我希望C3有日期类型。为了使它达到日期类型,我尝试了以下代码。

val textData = sqlContext.read.format("com.databricks.spark.csv")
    .option("header", "false")
    .option("delimiter", ",")
    .option("dateFormat", "yyyy-MM-dd")
    .option("inferSchema", "true")
    .option("nullValue", "null")
    .load("test.csv")

scala> textData.printSchema
root
 |-- C0: string (nullable = true)
 |-- C1: string (nullable = true)
 |-- C2: string (nullable = true)
 |-- C3: timestamp (nullable = true)
 |-- C4: string (nullable = true)
 |-- C5: timestamp (nullable = true)
 |-- C6: string (nullable = true)

scala> textData.show()
+---+---+---+--------------------+---+--------------------+---+
| C0| C1| C2|                  C3| C4|                  C5| C6|
+---+---+---+--------------------+---+--------------------+---+
|  a|  b|  c|2016-09-09 00:00:...|  a|2016-11-11 00:00:...|  a|
|  a|  b|  c|2016-09-10 00:00:...|  a|2016-11-11 00:00:...|  a|
+---+---+---+--------------------+---+--------------------+---+

此代码与第一个块之间的唯一区别是 dateFormat 选项行(我使用“yyyy-MM-dd”而不是“yyyy- MM-dd HH:mm:ss“)。现在我将C3和C5都作为时间戳(C3仍然不是日期)。但是对于C5,HH :: mm:ss部分被忽略并在数据中显示为零。

理想情况下,我希望C3为date类型,C5为timestamp类型,其HH:mm:ss部分不被忽略。我的解决方案现在看起来像这样。我通过从我的数据库并行提取数据来制作csv。我确保将所有日期作为时间戳(不理想)。所以,测试csv现在看起来像这样:

$ hadoop fs -cat new-test.csv
a,b,c,2016-09-09 00:00:00,a,2016-11-11 09:09:09.0,a
a,b,c,2016-09-10 00:00:00,a,2016-11-11 09:09:10.0,a

这是我最后的工作代码:

val textData = sqlContext.read.format("com.databricks.spark.csv")
    .option("header", "false")
    .option("delimiter", ",")
    .option("dateFormat", "yyyy-MM-dd HH:mm:ss")
    .schema(finalSchema)
    .option("nullValue", "null")
    .load("new-test.csv")

在这里,我在dateFormat中使用完整的时间戳格式(“yyyy-MM-dd HH:mm:ss”)。我手动创建finalSchema实例,其中c3是日期,C5是Timestamp类型(Spark sql类型)。我应用这些架构使用schema()函数。输出如下:

scala> finalSchema
res4: org.apache.spark.sql.types.StructType = StructType(StructField(C0,StringType,true), StructField(C1,StringType,true), StructField(C2,StringType,true), StructField(C3,DateType,true), StructField(C4,StringType,true), StructField(C5,TimestampType,true), StructField(C6,StringType,true))

scala> textData.printSchema()
root
 |-- C0: string (nullable = true)
 |-- C1: string (nullable = true)
 |-- C2: string (nullable = true)
 |-- C3: date (nullable = true)
 |-- C4: string (nullable = true)
 |-- C5: timestamp (nullable = true)
 |-- C6: string (nullable = true)


scala> textData.show()
+---+---+---+----------+---+--------------------+---+
| C0| C1| C2|        C3| C4|                  C5| C6|
+---+---+---+----------+---+--------------------+---+
|  a|  b|  c|2016-09-09|  a|2016-11-11 09:09:...|  a|
|  a|  b|  c|2016-09-10|  a|2016-11-11 09:09:...|  a|
+---+---+---+----------+---+--------------------+---+

是否有更简单或开箱即用的方法来解析csv文件(日期和时间戳类型都包含在火花数据框中?

相关链接:
http://spark.apache.org/docs/latest/sql-programming-guide.html#manually-specifying-options
https://github.com/databricks/spark-csv

2 个答案:

答案 0 :(得分:3)

对于非平凡案例的推断选项,它可能不会返回预期结果。正如您在InferSchema.scala中看到的那样:

if (field == null || field.isEmpty || field == nullValue) {
  typeSoFar
} else {
  typeSoFar match {
    case NullType => tryParseInteger(field)
    case IntegerType => tryParseInteger(field)
    case LongType => tryParseLong(field)
    case DoubleType => tryParseDouble(field)
    case TimestampType => tryParseTimestamp(field)
    case BooleanType => tryParseBoolean(field)
    case StringType => StringType
    case other: DataType =>
      throw new UnsupportedOperationException(s"Unexpected data type $other")

它只会尝试将每个列与时间戳类型匹配,而不是日期类型,因此这种情况下的“开箱即用解决方案”是不可能的。但根据我的经验,“更简单”的解决方案是使用needed type直接定义模式,它将避免推断选项设置仅匹配RDD而不是整个数据的类型。您的最终架构是一种有效的解决方案。

答案 1 :(得分:0)

这不是很优雅,但是您可以像这样从时间戳转换为日期(请检查最后一行):

val textData = sqlContext.read.format("com.databricks.spark.csv")
    .option("header", "false")
    .option("delimiter", ",")
    .option("dateFormat", "yyyy-MM-dd")
    .option("inferSchema", "true")
    .option("nullValue", "null")
    .load("test.csv")
    .withColumn("C4", expr("""to_date(C4)"""))