我在python中编写了一个正常运行的Spark程序。
然而,就内存消耗而言,它是低效的。我正在尝试优化它。我在AWS EMR上运行它并且EMR因为耗费太多内存而终止了工作。
Lost executor 11 on ip-*****: Container killed by YARN for exceeding memory limits. 11.4 GB of 10.4 GB physical memory used. Consider boosting spark.yarn.executor.memoryOverhead.
我认为这个内存问题是由于我在多个实例中收集我的RDD(即使用.collect()),因为在后面的阶段,我需要测试列表中是否存在某些值RDD与否。
所以,目前我的代码看起来像这样:
myrdd = data.map(lambda word: (word,1)) \
.reduceByKey(lambda a,b: a+b) \
.filter(lambda (a, b): b >= 5) \
.map(lambda (a,b) : a) \
.collect()
以后的代码
if word in myrdd:
mylist.append(word)
myrdd2 = data2.map(lambda word: (word,1)) \
.reduceByKey(lambda a,b: a+b) \
.filter(lambda (a, b): b >= 5) \
.map(lambda (a,b) : a) \
.collect()
if word in myrdd2:
mylist2.append(word)
然后我多次重复这个模式。
有没有办法进行操作
if word in myrdd:
do something
没有先收集rdd?
是否有类似rdd.contains()的函数?
P.S:我没有在内存中缓存任何东西。我的火花背景如下:jobName = "wordcount"
sc = SparkContext(appName = jobName)
......
......
sc.stop()
答案 0 :(得分:3)
来自YARN的错误消息说collect
不是问题,因为执行者(而不是驱动程序)有内存问题。
首先,尝试按照错误消息建议并提升spark.yarn.executor.memoryOverhead
- 在YARN上运行pyspark时,您可以告诉YARN为python worker进程内存分配更大的容器。
接下来,查看执行程序需要大量内存的操作。您使用reduceByKey
,也许您可以增加分区数量,使其在使用的内存方面更小。查看numPartitions
参数:http://spark.apache.org/docs/latest/api/python/pyspark.html#pyspark.RDD.reduceByKey
最后,如果你想检查rdd是否包含某个值,那么只需按此值过滤并使用count
或first
进行检查,例如:
looking_for = "....."
contains = rdd.filter(lambda a: a == looking_for).count() > 0