我们目前遇到的问题是,在YARN上运行时,Spark作业会因为超出内存限制而导致许多容器被杀死。
16/11/18 17:58:52 WARN TaskSetManager: Lost task 53.0 in stage 49.0 (TID 32715, XXXXXXXXXX):
ExecutorLostFailure (executor 23 exited caused by one of the running tasks)
Reason: Container killed by YARN for exceeding memory limits. 12.4 GB of 12 GB physical memory used.
Consider boosting spark.yarn.executor.memoryOverhead.
以下参数通过spark-submit传递:
--executor-memory=6G
--driver-memory=4G
--conf "spark.yarn.executor.memoryOverhead=6G"`
我正在使用Spark 2.0.1。
在阅读有关YARN查杀容器的几篇帖子(例如How to avoid Spark executor from getting lost and yarn container killing it due to memory limit?)之后,我们已将memoryOverhead增加到此值。
鉴于我的参数和日志消息,它似乎“当内存使用量大于(executor-memory + executor.memoryOverhead)时,Yarn会杀死执行程序”。
继续增加这种开销是不切实际的,希望最终我们找到一个不会发生这些错误的值。我们在几个不同的工作中看到了这个问题。我将不胜感激任何关于我应该改变的参数的建议,我应该检查的东西,我应该开始调试这个等等。能够提供进一步的配置选项等。
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您可以使用spark-defaults.conf
中的以下配置减少内存使用量:
spark.default.parallelism
spark.sql.shuffle.partitions
当您为spark.sql.shuffle.partitions
使用超过2000个分区时,会有所不同。你可以在Github上的spark代码中看到它:
private[spark] object MapStatus {
def apply(loc: BlockManagerId, uncompressedSizes: Array[Long]): MapStatus = {
if (uncompressedSizes.length > 2000) {
HighlyCompressedMapStatus(loc, uncompressedSizes)
} else {
new CompressedMapStatus(loc, uncompressedSizes)
}
}
我建议尝试使用超过2000个分区进行测试。当你使用非常庞大的数据集时,它可能会更快一些。根据{{3}},您的任务可以短至200毫秒。正确的配置不容易找到,但根据您的工作量,它可以产生不同的小时数。