3天到R,无法弄清楚我做错了什么。我试图将一些带有双向交互的列发送到glmnet cox模型中。我有一些data.frame()叫做dtable
编辑以使代码可重现
xs<-c("Col1", "Col2", "Col3")
v<-c(1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, NA, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, NA, 25, 26, 27, 28, 29, 30)
df<-data.frame(matrix(v,ncol=3))
dm<-as.matrix(df)
dm<-matrix(dm[complete.cases(dm)], ncol=3)
colnames(dm)<-xs
dfdata<-data.frame(dm)
f<-as.formula(time~.*.)
xmatrix<-model.matrix(f, dfdata)[,-1]
当我运行此操作时,我收到错误
Error in model.frame.default(object, data, xlev = xlev) :
object is not a matrix
提前致谢
答案 0 :(得分:1)
这是因为公式:时间〜。*。 在data.frame()中,公式没有时间列来跨越所有内容。
答案 1 :(得分:0)
我怀疑这个错误确切地说明了什么是错的。您传递给model.matrix()
的对象不是矩阵。 class(data)
的结果是什么?可能是data.frame。
尝试将as.matrix()
添加到对model.matrix()
的{{1}}来电。
另外两个注意事项 - 不要调用data.frames data
。此处还使用可重现的示例提出问题。你会得到更好的回应。
答案 2 :(得分:0)
我认为不是这样:
dm<-matrix(dm[complete.cases(dm)], ncol=3)
你想要这个:
dm <- as.matrix(dm[complete.cases(dm), ])
不要用自己的号角(太多),但考虑使用glmnetUtils来简化管理数据帧,公式和模型矩阵的任务。