在akka流中查找模式

Question

在我的scala代码中，我有一个akka流（Source [ByteString，Long]），我在这个流中搜索一个模式（例如“aabb”），如果存在该位置。

有可能吗？

该流包含基因组序列（20至64Mb）。如果序列包含32个核碱基的模式，那么可能这个序列很有意思，我将它保存在首次出现的位置，否则就是浪费。 如果使用了输入流，我可以创建一个32字节的字节缓冲区并检查bytebuffer中的序列。使用akka流还有另一种模式可以完成它

Answer 1

这将是棘手的，因为字节模式可能跨越流中的两个ByteString。

如果您确定所有消息都适合内存，最简单的方法是将流聚合成单个字节字符串并搜索。

可以不将流聚合到单个字符串中，但我不认为它是内置的.Akka HTTP中的akka.http.scaladsl.unmarshalling.MultipartUnmarshallers代码显示了如何在流式传输中执行此操作方式，但它非常繁琐。 （Akka通过akka.http.impl.engine.parsing.BodyPartParser状态机管道流。）

问题需要澄清

你的用例是什么？

大多数Reactive Streams只消耗一次，那么您打算如何处理索引呢？

如果您尝试解析HTTP实体中的MIME边界，请直接使用Akka的MultipartUnmarshallers代码。