安装“ReporteRs”和“ReporteRsjars”

时间:2016-11-17 00:50:10

标签: r reporters

最终我正在尝试在 Windows 7 系统上安装R包ReporteRsReporteRs_0.8.7.tar.gz)(会话信息,以及下面的其他信息)。这取决于我遇到安装错误的包ReporteRsjarsReporteRsjars_0.0.2.tar.gz)。

这还取决于安装的R包rJava以及JDK / JRE(jre1.8.0_112)。

我在没有互联网访问权限的计算机上进行安装,所以我在本地版本的CRAN上安装PACKAGESPACKAGES.gz。这一直没有任何问题(至少现在是这样)。

rJava加载没有任何问题,但在安装ReporteRsjars时,我收到以下错误(请参阅下面的安装尝试错误)。

注意:其他StackOverflow问题似乎更关注library(rJava)有问题,而不是在安装依赖于rJava的软件包时。

rJava DLL 位于以下位置:

C:/Program Files/R/R-3.3.2/library/rJava/libs/x64/rJava.dll

重新安装了多次(成功)。

sessionInfo以及更多信息低于错误(包括我尝试的内容)。

安装尝试错误

cran_dir_url设置为CRAN包所在的路径。这个前缀为file://

> library(rJava)
> install.packages('ReporteRsjars', contriburl=cran_dir_url, repos = cran_dir_url, type = 'source')

## * installing *source* package 'ReporteRsjars' ...
## ** package 'ReporteRsjars' successfully unpacked and MD5 sums checked
## ** R
## ** inst
## ** preparing package for lazy loading
## ** help
## No man pages found in package  'ReporteRsjars' 
## *** installing help indices
## ** building package indices
## ** testing if installed package can be loaded
## *** arch - i386
## Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'rJava', details:
##   call: library.dynam("rJava", pkgname, libname)
##   error: DLL 'rJava' not found: maybe not installed for this architecture?
## Error: loading failed
## Execution halted
## *** arch - x64
## ERROR: loading failed for 'i386'
## * removing 'C:/Program Files/R/R-3.3.2/library/ReporteRsjars'
## Warning in install.packages :
##   running command '"C:/PROGRA~1/R/R-33~1.2/bin/x64/R" CMD INSTALL -l "C:\Program Files\R\R-3.3.2\library" /Users/cirina_ext/Documents/StevenBanville/CRAN_Targeted/ReporteRsjars_0.0.2.tar.gz' had status 1
## Warning in install.packages :
##   installation of package 'ReporteRsjars' had non-zero exit status
## 

环境信息&工具

路径信息:以下内容包含在系统路径中,是安装Java的地方。

C:\Program Files\Java\jre1.8.0_112\bin\;C:\Program Files\Java\jre1.8.0_112\bin\server\;%path%

(JDK安装程序:jdk-8u112-windows-x64)

Rtools版本和位置

版本:3.4.0.1962 地点:C:\Rtools

我尝试过什么

  • 我开始尝试安装ReporteRs R软件包,这会安装所有依赖项但在ReporteRsjars软件包上失败。

  • 安装JDK / JRE后,我重新安装了rJava(在安装R软件包的各种尝试后,这已经完成了几次)。所有rJava次安装都是成功的,library(rJava)也是如此。

  • 我试图在Windows命令窗口中运行以下命令,因为我已经在许多SO答案中看到了这个建议。

      

    R CMD javareconf

         

    'javareconf'未被识别为内部或外部命令,可操作程序或批处理文件。

  • 我试图在rJava系统变量中包含path DLL的路径但不起作用。

  • 注意:在每次尝试之后我重新启动了RGui和RStudio(我在这两种环境中都尝试过)。我也重新启动了机器。

  • 我做了很多谷歌搜索并查看了StackOverflow,但发现的所有问题都与此不一样。它们看似相似,但在尝试了很多事情后,我仍然遇到上述错误。我已经省略了我看过的链接,但如果有帮助的话可以添加它们。

帮助我排除故障并解决此问题的指南将不胜感激。

会话信息

> sessionInfo('rJava')
## R version 3.3.2 (2016-10-31)
## Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
## Running under: Windows 7 x64 (build 7601) Service Pack 1
## 
## locale:
## [1] LC_COLLATE=English_United States.1252  LC_CTYPE=English_United States.1252   
## [3] LC_MONETARY=English_United States.1252 LC_NUMERIC=C                          
## [5] LC_TIME=English_United States.1252    
## 
## attached base packages:
## character(0)
## 
## other attached packages:
## [1] rJava_0.9-8
## 
## loaded via a namespace (and not attached):
## [1] graphics_3.3.2  tools_3.3.2     utils_3.3.2     grDevices_3.3.2 stats_3.3.2     datasets_3.3.2 
## [7] methods_3.3.2   base_3.3.2     

修改

我尝试在只有64位版本的Java(并确认它是64位)的另一台机器上进行相同的安装并得到相同的错误。这是一个片段,但它与上面的错误相同:

...
*** arch - i386
Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'rJava', details:
  call: library.dynam("rJava", pkgname, libname)
  error: DLL 'rJava' not found: maybe not installed for this architecture?
Error: loading failed
Execution halted
...

我仍在查看@ 42-评论中的链接,但这似乎不是JRE / JDK不是64位的问题。

编辑2

注意:这不是一个答案,因为它只是一种解决方法。

我找到了一个不太理想的解决方法。看起来本地CRAN副本的安装并不像我预期的那么相似。我使用非本地CRAN(即通常的方式)在等效的Windows 7机器上安装有问题的库安装,并将目录复制到另一台机器(即未连接到互联网的机器)。这看起来有效,但不清楚为什么其他方法没有(带有更新的PACKAGES文件的本地CRAN副本)。我注意到的一件事是,当访问通常的CRAN存储库时,它使用了.zip版本的库而不是tar.gz;我不确定这是否重要。

编辑3

根据David Gohel在此ReporteRs Issues中的回复,添加了INSTALL_opts = "--no-multiarch"的以下代码可能会解决此问题:

install.packages("ReporteRs", contriburl=cran_dir_url,
                 repos = cran_dir_url, 
                 type = 'source', INSTALL_opts = "--no-multiarch")

如果我确定它可以解决问题,我会将其添加为答案,但是,我已经实施了 EDIT 2 中提到的解决方法。

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

根据David Gohel在此GitHub ReporteRs Issues中的回复,添加了INSTALL_opts = "--no-multiarch"的以下代码修复了我遇到的问题:

install.packages("ReporteRs", contriburl=cran_dir_url,
                 repos = cran_dir_url, 
                 type = 'source',
                 INSTALL_opts = "--no-multiarch")