Question

我想在目录中的所有.fa文件中运行程序（锚点），并将输出追加到输入文件中（作为原始输入内容的下一行）。为此，我尝试过：

for f in ./*.fa ; do ./anchor $f -d ./; done >> $f

它给出了错误：

bash: $f: ambiguous redirect

我理解bash反对在输入文件中发布输出内容，但是因为我最近从windows系统迁移，所以我这样做：

for %F in ("*.fa") do anchor %F -d ./ >> %%F

给了我想要的输出。

虽然在输入文件中附加输出似乎很奇怪，但是如何在shell中执行此操作？

由于

PS。我也尝试在输出重定向中使用$$，但它形成一个具有不同名称的单独输出文件，并且原始输入内容也未合并在其中。

Answer 1

最合乎逻辑的方法是从循环内部重定向，而不是直接重定向（感谢123的评论：文件不能同时输入和输出，也许在这里它可以工作，因为Windows循环似乎工作，但不要冒无用的风险......）

for f in ./*.fa ; do ./anchor $f -d ./ > /tmp/something; cat /tmp/something >> $f; done

BTW：我不敢尝试解释原始代码的作用，f定义/评估$f时（进入for循环之前或之后）

我的猜测是$f只是不评估并被视为$f字面意思，这会让bash感到困惑。

无论如何，这是不正确的。

编辑：Windows版

for %F in ("*.fa") do anchor %F -d ./ >> %%F

重定向在循环中（与你的unix尝试不同），并且由于windows文件锁定而真的令人惊讶，因为windows文件锁定...

可能发生的事情（不确定）是Windows在标准输出上发出某些内容之前没有尝试附加到该文件，此时程序已将该文件作为输入关闭。