Question

我在创建合适的Barplot时遇到问题。这是我的数据：

 Site Leaftype Bacteria_per_mm2           SD
1     A        E        1733540.8    455950.56
2     A        B        1062815.7    352876.56
3     A     MI_E        1414862.9    442902.69
4     A     MI_B         638189.9    287774.87
5     B        E              0.0         0.00
6     B        B              0.0         0.00
7     B     MI_E              0.0         0.00
8     B     MI_B         639858.4    213881.70
9     C        E        1862013.0    802574.16
10    C        B         628596.2    153344.48
11    C     MI_E        1417365.6    374644.06
12    C     MI_B         502209.6    270575.29
13    D        E              0.0         0.00
14    D        B         614831.3    176989.64
15    D     MI_E              0.0         0.00
16    D     MI_B       38271374.5 133237805.80
17    E        E        1084505.8    604725.59
18    E        B         306164.3    113604.13
19    E     MI_E         588135.8    178212.25
20    E     MI_B         294207.0    119656.46
21    F        E        1712406.8   1378365.84
22    F        B         329522.9    123385.05
23    F     MI_E              0.0         0.00
24    F     MI_B         389865.9    122340.59
25    G        E              0.0         0.00
26    G        B        6934997.3  28121464.95
27    G     MI_E         957702.0    235390.37
28    G     MI_B         373737.4    131594.27
29    H        E        1677647.0    609105.40
30    H        B         438390.6    145930.97
31    H     MI_E              0.0         0.00
32    H     MI_B         602317.8    187389.36
33    I        E        1683903.8    303170.48
34    I        B              0.0         0.00
35    I     MI_E              0.0         0.00
36    I     MI_B         407941.0    135698.56
37    K        E        1257192.5    297964.48
38    K        B         291982.3    124092.78
39    K     MI_E        1209432.5   1670628.39
40    K     MI_B         442144.7    182276.10
41    L        E        1453793.9    703390.84
42    L        B         663495.1    313438.15
43    L     MI_E        1405130.2  11237373.56
44    L     MI_B        2775709.1   9921931.93
45    N        E         461332.1    120115.39
46    N        B         760822.5    285298.68
47    N     MI_E        1647614.5    260567.19
48    N     MI_B         615109.4    171088.51
49    O        E         931423.6    498561.29
50    O        B         299768.5    144299.92
51    O     MI_E        1112035.5    285024.12
52    O     MI_B         335362.6    114015.88
53    P        E              0.0         0.00
54    P        B         501375.4     84989.70
55    P     MI_E              0.0         0.00
56    P     MI_B         869273.1    149036.53
57    Q        E         961873.2    189228.01
58    Q        B         381523.6    168520.10
59    Q     MI_E         894300.1    184394.29
60    Q     MI_B              0.0         0.00
61    R        E         966878.6    209821.35
62    R        B         284474.2     80791.71
63    R     MI_E         903893.8    558948.64
64    R     MI_B              0.0         0.00
65    S        E              0.0         0.00
66    S        B        1076163.4    927758.07
67    S     MI_E        1137479.7    305446.03
68    S     MI_B         802812.3    190456.51
69    T        E              0.0         0.00
70    T        B        2287681.5  10420861.06
71    T     MI_E              0.0         0.00
72    T     MI_B         761656.7    406262.84

我尝试创建一个条形图，它显示了不同Sites和每个Leaftype每mm2叶面的细菌数量，因此我想创建一个带有y的条形图（响应）变量和2个分类变量。我的第一个问题是，Leaftype和Sites不是数字而R告诉我，不可能创建一个带有变量的条形图，这些变量不是数字向量。

这是我使用的代码：

Bacteria_all<-read.delim("Mean_Bacteria_counts_final.csv", header = TRUE, sep = ";")# my data
Bacteria_all
str(Bacteria_all)
mean5<-Bacteria_all$Bacteria_per_mm2
mean5
sd5<-Bacteria_all$SD
sd5

library(ggplot2)
ggplot(data=Bacteria_all)+
  geom_bar(stat="identity",aes(x=Site,y=mean5),fill = "forestgreen")+
  theme_bw()+
  geom_errorbar(aes(x=Site,ymin=mean5-sd5,ymax=mean5+sd5),width=0.5)+
  ylim(0,1000000)+
  labs(x='Sites and Tree Species',y= 'Bacterial number per mm2 leafsurface')

这是合适的图像，但Leaftypes缺失。

enter image description here

你可以帮我解决这个问题吗？我发现了一些相关问题，但我无法将这些答案应用于我的问题，我是R的初学者！

希望你能帮助我！

Answer 1

如何按facet_wrap

将leaftype添加到方面

ggplot(data=Bacteria_all)+
geom_bar(stat="identity",aes(x=Site,y=mean5),fill = "forestgreen")+
theme_bw()+
geom_errorbar(aes(x=Site,ymin=mean5-sd5,ymax=mean5+sd5),width=0.5)+
ylim(0,1000000)+
labs(x='Sites and Tree Species',y= 'Bacterial number per mm2 leafsurface') + 
facet_wrap( ~ Leaftype, ncol=2)

（注意：我只花了几行数据才能做到这一点。）

另一种方法是通过叶型躲避条形图，但这样做会更复杂，看起来可能不太好。

如何创建包含3个变量的Barplot？

1 个答案: