只有在我自己的库中使用它时,Armadillo才会链接错误

时间:2016-11-08 10:07:17

标签: c++ lapack armadillo

当我在自己的图书馆里使用Armadillo时,我遇到了一些麻烦。我安装了Armadillo,我创建了自己的库,调用了svd_econ方法。这是CMakeList.txt文件:

cmake_minimum_required (VERSION 2.8.9)
set(PROJECTNAME training_library)
project(${PROJECTNAME})

if (NOT DEFINED ENV{EIGEN_ROOT})
message(FATAL_ERROR "Could not find EIGEN_ROOT environment variable")
endif()

find_package(Armadillo REQUIRED)

include_directories("$ENV{EIGEN_ROOT}")

add_definitions(-g)
add_definitions(-O3)
add_definitions(-DNDEBUG)

include_directories(${ARMADILLO_INCLUDE_DIRS})
include_directories(${PROJECT_SOURCE_DIR}/include)

file(GLOB header include/*.h)
file(GLOB source src/*.cpp)

source_group("Source Files" FILES ${source})
source_group("Header Files" FILES ${header})

add_library(${PROJECTNAME} ${source} ${header})
target_link_libraries(${PROJECTNAME} ${ARMADILLO_LIBRARIES})

这是头文件:

#include <algorithm>
#include <string>
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>
#include <string.h>
#include <vector>
#include <iostream>
#include <fstream>
#include <sstream>
#include <armadillo>
#include <Eigen/Dense>
#include <Eigen/SVD>

namespace statistics
{
  bool findPCS(const Eigen::MatrixXd &data, Eigen::VectorXd &eigenvalues, Eigen::MatrixXd &eigenvectors);
}

#endif

这是.cpp:

#include "statistics.h"

namespace statistics
{

Eigen::MatrixXd convert(const arma::mat &data)
{
  Eigen::MatrixXd res(data.n_rows,data.n_cols);
  for (int i = 0; i < data.n_rows; i++)
  {
    for (int j = 0; j < data.n_cols; j++)
    {
      res(i,j) = data(i,j);
    }
  }
  return res;  
}

arma::mat convert(const Eigen::MatrixXd &data)
{
  arma::mat res(data.rows(),data.cols());
  for (int i = 0; i < data.rows(); i++)
  {
    for (int j = 0; j < data.cols(); j++)
    {
      res(i,j) = data(i,j);
    }
  }
  return res;  
}

Eigen::VectorXd convert(const arma::vec &data)
{
  Eigen::VectorXd res(data.size());
  for (int i = 0; i < data.size(); i++)
  {
    res(i) = data(i);
  }
  return res;  
}

arma::vec convert(const Eigen::VectorXd &data)
{
  arma::vec res(data.size());
  for (int i = 0; i < data.size(); i++)
  {
    res(i) = data(i);
  }
  return res;
}

bool findPCS(const Eigen::MatrixXd &data, Eigen::VectorXd &eigenvalues,  Eigen::MatrixXd &eigenvectors)
{  
  arma::mat arma_mat = convert(data);
  arma::mat U; arma::vec S; arma::mat V;
  arma::svd_econ(U,S,V,arma_mat);    
  eigenvalues = convert(S)/sqrt((double)(data.rows()));    
  eigenvectors = convert(V);

  return true;
}

}

现在,这个库编译没有任何问题。然后,我想从另一个名为clean_data的不同模块调用findPCS方法。它的CMakeLists.txt文件如下:

cmake_minimum_required (VERSION 2.8.9)
set(PROJECTNAME clean_data)
project(${PROJECTNAME})

find_package(OpenCV REQUIRED)
find_package(Armadillo REQUIRED)

if (NOT DEFINED ENV{EIGEN_ROOT})
message(FATAL_ERROR "Could not find EIGEN_ROOT environment variable")
endif()

include_directories("$ENV{EIGEN_ROOT}")
include_directories("$ENV{training_INCLUDE}")
link_directories("$ENV{training_LIBS}")

add_definitions(-g)
add_definitions(-O3)
add_definitions(-DNDEBUG)

file(GLOB SOURCES *.c *.cpp)

add_executable(${PROJECTNAME} ${SOURCES})
target_link_libraries(${PROJECTNAME} ${OpenCV_LIBS} ${ARMADILLO_LIBRARIES} training_library)

调用findPCS方法的main.cpp如下:

#include <armadillo>
#include <string>
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>
#include <string.h>
#include <vector>
#include <iostream>
#include <fstream>
#include <ctime>
#include <algorithm>
#include <numeric>
#include <list>
#include <statistics.h>
#include <opencv2/opencv.hpp>
#include <Eigen/Dense>

int main() {

  Eigen::MatrixXd matrix(4,10);
  matrix << 1, 2, 2, 1, 5, 5, 4, 12, 32, 1,
        44, 34, 12, 11, 21, 5, 54, 1, 12, 3,
        33, 128, 112, 126, 3, 3, 2, 12, 1, 54,
        66, 34, 1, 54, 2, 2, 1, 43, 4, 12;
  Eigen::VectorXd eigenval; Eigen::MatrixXd eigenvec;
  statistics::findPCS(matrix,eigenval,eigenvec);

  //arma::mat x = arma::randu<arma::mat>(3,4);
  //arma::mat U; arma::vec S; arma::mat V;
  //arma::svd(U,S,V,x);

  return 0;
}

当我尝试编译时,这段代码给了我这个链接错误:

/home/ilaria/Dev/training_library/build/libtraining_library.a(statistics.cpp.o):     In function `gesdd<double>':
/usr/local/include/armadillo_bits/wrapper_lapack.hpp:571: undefined     reference to `wrapper_dgesdd_'
/home/ilaria/Dev/training_library/build/libtraining_library.a(statistics.cpp.o):     In function `gesvd<double>':
/usr/local/include/armadillo_bits/wrapper_lapack.hpp:506: undefined     reference to `wrapper_dgesvd_'
/usr/local/include/armadillo_bits/wrapper_lapack.hpp:506: undefined reference to `wrapper_dgesvd_'
collect2: error: ld returned 1 exit status
make[2]: *** [clean_data] Error 1
make[1]: *** [CMakeFiles/clean_data.dir/all] Error 2
make: *** [all] Error 2

但是,如果我取消在main.cpp中注释的行,代码编译没有任何问题,它运行正常,它给了我正确的结果!我在网上看了,我找不到任何有用的答案。我使用的是Ubuntu 14.04。我从源头安装了犰狳,并从突触中安装了lapack,blas和openblas。有人能在任何地方发现问题吗?任何帮助将不胜感激。

谢谢, ILARIA

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

您的问题归结为图书馆链接顺序。我不知道你的完整链接线,但这是一个简化来说明问题:

gcc -o myOutput main.o -l someLibrary -l training_library

现在training_library.a包含对外部符号的引用:特别是wrapper_dgesvd_等。这些实际上是在someLibrary.a中定义的(我不知道这里的实际库名,所以用这个名字来说明我的观点)。但是,由于上面的-l顺序无法解析(规则是链接器行上的未解析符号从左到右处理,并且只有-l条目出现在右侧引入未解析符号的点可以解决它)。

那么为什么取消注释main.cpp中的行会有帮助?因为可能(在引擎盖下)在注释行中进行调用会引用那些相同的未解析符号(例如wrapper_dgesvd_)。因为这些现在被引入-l someLibrary的左侧,现在可以用它来解决它们,因此它们被拉入。一旦被拉入,它们现在也可用于稍后在命令行中出现的内容,即training_library,所以你早先的问题就消失了。

如何解决这个问题?只是一个猜测,但尝试更改您的CMake行:

target_link_libraries(${PROJECTNAME} ${OpenCV_LIBS} ${ARMADILLO_LIBRARIES} training_library)

要:

target_link_libraries(${PROJECTNAME} training_library ${OpenCV_LIBS} ${ARMADILLO_LIBRARIES})
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