如何在R中调整此特征的数据结构?

时间:2016-11-04 20:36:02

标签: r data-structures eigenvector

我有一个corr矩阵列表[1:1505, 1:1505]。 我正在考虑如何为R中的Eigen调整它们。 最初的线程How to adjust this data structure for smaller segments in R?只包含一个测试函数cor,最后还不够,所以这里是第二个测试函数 - cor矩阵的Eigen

# https://stackoverflow.com/q/40429343/54964
set.seed(24)
A=541650
m1 <- matrix(1:A, ncol=4, nrow=A)

a=360; b=1505; c=4;
m2 <- array(`length<-`(m1, a*b*c), dim = c(a,b,c))

res <- lapply(seq(dim(m2)[3]), function(i) cor(m2[,,i]))

res2 <- lapply(res, function(x) eigen(replace(x, is.na(x), 0))$vectors[,1:2])

str(res2)

e1 <- res[,1]
e2 <- res[,2]

输出

List of 4
 $ : num [1:1505, 1:2] -0.0144 0.0512 0.0157 -0.0232 0.0248 ...
 $ : num [1:1505, 1:2] 0.02233 0.00977 -0.02361 0.01597 0.00115 ...
 $ : num [1:1505, 1:2] -0.005876 0.000417 0.008206 0.006237 0.01514 ...
 $ : num [1:1505, 1:2] 0.00844 0.04382 0.0203 0.0348 0.02553 ...
Error in res2[, 1] : incorrect number of dimensions
Execution halted

R:3.3.1
操作系统:Debian 8.5

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

我认为完整的功能代码基于akrun的初步答案,他的评论和一些迭代

# http://stackoverflow.com/q/40429343/54964
set.seed(24)
A=541650
m1 <- matrix(1:A, ncol=4, nrow=A)

a=360; b=1505; c=4;
# http://stackoverflow.com/a/40430229/54964
m2 <- array(`length<-`(m1, a*b*c), dim = c(a,b,c))

res <- lapply(seq(dim(m2)[3]), function(i) cor(m2[,,i]))

res2 <- lapply(res, function(x) eigen(replace(x, is.na(x), 0))$vectors[,1:2])

str(res2)

e1 <- res[1]
e2 <- res[2]

str(e1)

str(e2)

输出

List of 4
 $ : num [1:1505, 1:2] -0.0258 -0.0258 -0.0258 -0.0258 -0.0258 ...
 $ : num [1:1505, 1:2] -0.0258 -0.0258 -0.0258 -0.0258 -0.0258 ...
 $ : num [1:1505, 1:2] -0.0258 -0.0258 -0.0258 -0.0258 -0.0258 ...
 $ : num [1:1505, 1:2] -0.0258 -0.0258 -0.0258 -0.0258 -0.0258 ...
List of 1
 $ : num [1:1505, 1:1505] 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
List of 1
 $ : num [1:1505, 1:1505] 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...