Question

我有一个包含“特殊字符”的RMarkdown文档，例如ë。如果我使用RStudio Server的“编织文档”按钮渲染文档，它会渲染得很好。当我通过使用RStudio Server按钮来渲染另一个调用RMarkdown的{{1}}函数的R脚本来渲染它时，它也会渲染得很好。

然而，由于某种原因超出了我（但希望不会长久），当render使用以下内容调用相同的R脚本时，我会得到不同的结果：

index.php

当我这样做时，在生成的.html文件中，特殊符号（我猜unicode符号）被$results = shell_exec("R --file='/home/username/public_html/some/subdirectories/process.R' --no-save 2>&1");替换。我试图查看这是否是某种我尚未了解的HTML元素变体，但我一直无法找到任何相关内容。

（注意：任何指向我可以了解更多相关信息的地方的链接（而且，当我们看到它时，为什么我的浏览器不显示它，例如，它代表的ë，也非常感谢！）

可再现的示例

<U+00EB>的内容：

example.php

<?php shell_exec("R --file='/home/username/public_html/subdirectory/example.R' --no-save 2>&1"); ?>的内容（这是我在服务器上需要的内容）：

example.R

workingPath <- "/home/username/public_html/subdirectory"; ### Set path to RStudio's pandoc version Sys.setenv(PATH=paste(Sys.getenv("PATH"), "/usr/lib/rstudio-server/bin/pandoc", sep=":")); ### Set HOME and LANG Sys.setenv(HOME = '/home/username'); Sys.setenv(LANG = 'en_US.UTF-8'); require(rmarkdown); renderResults <- render(file.path(workingPath, 'example.Rmd'), output_file = file.path(workingPath, 'example.html'), intermediates_dir = file.path(workingPath, 'tmp'), encoding="UTF-8");的内容：

example.Rmd

此示例的结果：

当我从R Studio运行时，我得到：

cat（“这是一个符号。”）;

##这是一个ë符号。

当我从PHP运行时，我得到：

cat（“这是一个符号。”）;

##这是＆lt; U + 00EB＆gt;符号

（请注意，有趣的是，--- title: 'Reproducable example' output: html_document --- ```{r} cat("This is an ë symbol."); ```'edë确实正常出现......）

我现在在echo文件中使用了str_replace，但这并不理想。

我已经检查了index.php手册，但我找不到任何有关此行为的信息。

我还看过在.Rmd文件的YAML标题中指定render的选项，但似乎唯一接近的是--ascii option，这不是任何东西。 R Studio RMarkdown page也没有提供任何提示。

它可能与RStudio中设置的环境变量有关吗？我已经不得不设置：

pandoc

在R脚本中，在从PHP shell调用的R脚本中调用时，首先让Pandoc进入;但如果这是问题，我如何确定RStudio设置哪些设置值，或者更准确地说，哪些设置重要？我跑了：

Sys.setenv(HOME = '/home/oupsyusr');
Sys.setenv(LANG = 'en_US.UTF-8');

从R Studio中，显示了相当多的列表。我认为没有任何条目与编码等有关。

或者，knitr会导致这个吗？当我存储并检查.md文件时，Unicode元素已经显示出来了。但是，knitr help page with chunk options一般没有说明unicode或编码。

有人知道记录在哪里，或者有人碰巧遇到过这种情况吗？

我在CentOS 6.8上运行RStudio 0.99.903和R 3.3.1。

Answer 1

通常，此形式的问题（其中unicode字符转换为unicode代码点表示，在本例中为<U+00EB>）是由尝试在非UTF-8语言环境中运行R引起的。 / p>

通常，可以通过检查Sys.getlocale("LC_ALL")的输出来验证这一点。如果您看到报告了C语言环境，那么您可能需要使用以下内容强制执行UTF-8语言环境：

Sys.setlocale("LC_ALL", "en_US.UTF-8")

根据您所需的语言替换特定的UTF-8语言环境。（作为参考，通常可以使用类似locale -a）的终端查询可用语言环境集。

为什么RMarkdown` render`行为取决于它是从RStudio Server还是从PHP shell调用的？

1 个答案: