R:如何通过install_github()安装特定版本?

时间:2016-10-21 14:39:55

标签: r devtools

如果当前版本的软件包出现一些错误,则用户可能更愿意安装特定版本(例如版本1.0.1)。可以使用哪种 R 代码来实现这一目标?

例如,发布最新的OhdsiRTools R包:

https://github.com/OHDSI/OhdsiRTools/tree/v1.0.1

命令如下:

install_github("OHDSI/OhdsiRTools", ref = 'v1.0.1')

上面的代码不正确。它仅适用于分支(例如masterdevA)。但devtools包具有引用版本的功能。

理想情况下,我会通过标签引用版本(但提交ID的解决方案也会起作用)。

EXTRA BONUS:什么代码可以安装“最新”版本。 (但请考虑这是一个奖金问题。问题是主要问题)

2 个答案:

答案 0 :(得分:12)

您需要将版本的标记直接附加到存储库参数的名称。因此,username/repo@releasetag将起作用。仅在需要引用git存储库的特定分支时才使用参数ref = "devA"

对于您的示例,关于OhdsiRTools v1.0.1,我们有

我们有:

devtools::install_github("OHDSI/OhdsiRTools@v1.0.1")

修改

在使用devtools来源进行游戏后,我注意到可以通过以下方式请求最新来源:

username/repo@*release

因此,您可以使用:

devtools::install_github("OHDSI/OhdsiRTools@*release")

结束修改

过时,请参阅编辑

不幸的是,为了获得最新的发布标记,其工作有点复杂,因为它涉及解析来自GitHub API的响应。如果你真的需要标记版本,这里有一些注释...你必须解析JSON:

https://api.github.com/repos/<user>/<repo>/releases/latest

使用RJSONIOjsonliterjson

从:

中提取"tag_name"
{
  "url": "https://api.github.com/repos/OHDSI/OhdsiRTools/releases/2144150",
  "assets_url": "https://api.github.com/repos/OHDSI/OhdsiRTools/releases/2144150/assets",
  "upload_url": "https://uploads.github.com/repos/OHDSI/OhdsiRTools/releases/2144150/assets{?name,label}",
  "html_url": "https://github.com/OHDSI/OhdsiRTools/releases/tag/v1.0.1",
  "id": 2144150,
  "tag_name": "v1.0.1",
  "target_commitish": "master",
  "name": "Minor bug fix",
  "draft": false,
  "author": {
    "login": "schuemie",
    "id": 6713328,
    "avatar_url": "https://avatars.githubusercontent.com/u/6713328?v=3",
    "gravatar_id": "",
    "url": "https://api.github.com/users/schuemie",
    "html_url": "https://github.com/schuemie",
    "followers_url": "https://api.github.com/users/schuemie/followers",
    "following_url": "https://api.github.com/users/schuemie/following{/other_user}",
    "gists_url": "https://api.github.com/users/schuemie/gists{/gist_id}",
    "starred_url": "https://api.github.com/users/schuemie/starred{/owner}{/repo}",
    "subscriptions_url": "https://api.github.com/users/schuemie/subscriptions",
    "organizations_url": "https://api.github.com/users/schuemie/orgs",
    "repos_url": "https://api.github.com/users/schuemie/repos",
    "events_url": "https://api.github.com/users/schuemie/events{/privacy}",
    "received_events_url": "https://api.github.com/users/schuemie/received_events",
    "type": "User",
    "site_admin": false
  },
  "prerelease": false,
  "created_at": "2015-11-18T00:55:28Z",
  "published_at": "2015-11-18T06:35:57Z",
  "assets": [

  ],
  "tarball_url": "https://api.github.com/repos/OHDSI/OhdsiRTools/tarball/v1.0.1",
  "zipball_url": "https://api.github.com/repos/OHDSI/OhdsiRTools/zipball/v1.0.1",
  "body": "Fixed bug in `convertArgsToList ` function."
}

以上摘自https://api.github.com/repos/OHDSI/OhdsiRTools/releases/latest

答案 1 :(得分:8)

对于到达这里寻找如何从特定提交SHA安装的任何人,这很简单:

remotes::install_github("username/repository@commitSHA")

示例

从github上的'commits'页上查找要安装的提交的SHA:

enter image description here

在这种情况下,提交SHA为:8bc79ec6dd57f46f753cc073a3a50e0921825260,简单来说:

remotes::install_github("wilkelab/ggtext@8bc79ec6dd57f46f753cc073a3a50e0921825260")