如何在bash脚本中运行.RMD(Rmarkdown)文件?

时间:2016-10-20 23:40:25

标签: r bash r-markdown

也许这是一个愚蠢的问题,但我无法找到答案 我是使用r-markdown的新手。

我在R中创建了一个脚本来进行一些统计计算和图形处理。完成脚本后,我的导师告诉我,R脚本以pdf格式生成报告是正确的。

我尝试在.R文件中使用不同的方法导出结果但最后我发现创建报告的最佳方法是r-markdonw。

但是,这个R脚本将在bash文件中用于自动化进程...示例:

  1. Java程序生成文件
  2. R脚本获取这些文件并进行一些统计计算。
  3. 以pdf或html格式生成清晰的报告。
  4. 我的问题是......如何在bash脚本中运行.RMD文件?

    编辑:

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