在Appveyor上设置R包SQL集成测试

时间:2016-10-19 16:55:37

标签: continuous-integration integration-testing devtools r-package appveyor

我希望在Appveyor上的R包中运行一些SQL集成测试。我使用mdf文件来设置感兴趣的数据库,但我发现在我的R包中有一个mdf文件的问题。以下是相关步骤:

1)在构建之前,调用PowerShell脚本以使用我的包中的mdf文件创建数据库。

  • 此步骤无错误地发生

2)yml文件通过travis-tool.sh run_tests运行R测试并尝试将R项目文件从c:\projects\HCRTools复制到构建目录,即C:\Users\appveyor\AppData\Local\Temp

  • 此步骤失败,因为mdf现在与SQL Server绑定,无法复制:

    " file.copy中的警告(pkgname,Tdir,recursive = TRUE):   问题复制。\ hcrtools \ inst \ CIDatabase \ SAM_log.ldf到C:\ Users \ appveyor \ AppData \ Local \ Temp \ 1 \ RtmpCq659a \ Rbuild92c6989d34 \ hcrtools \ inst \ CIDatabase \ SAM_log.ldf:权限被拒绝  错误 复制到构建目录失败"

非常感谢上传mdf工件的任何帮助,如果没有它也在R包中!无法完成这项工作。

yml文件:

init:
  ps: |
        $ErrorActionPreference = "Stop"
        Invoke-WebRequest http://raw.github.com/krlmlr/r-appveyor/master/scripts/appveyor-tool.ps1 -OutFile "..\appveyor-tool.ps1"
        Import-Module '..\appveyor-tool.ps1'
install:
  ps: Bootstrap

services:
  - mssql2012sp1

build_script:
  - ps: iex .\inst\CIDatabase\CIBuild_DBCreate.ps1 #<-- Create DB (w/ no error)!
  - Rscript -e "source('http://bioconductor.org/biocLite.R')" -e "chooseCRANmirror(ind=81)"
  - travis-tool.sh install_deps

test_script:
  - travis-tool.sh run_tests #<-- mdf copy error occurs!

on_failure:
  - 7z a failure.zip *.Rcheck\*
  - appveyor PushArtifact failure.zip

environment:
  global:
    WARNINGS_ARE_ERRORS: 0
    _R_CHECK_FORCE_SUGGESTS_: 1
    R_ARCH: x64

  matrix:
    - R_VERSION: release

用于上传工件和创建数据库的PowerShell文件:

#-- Push artifacts up
Push-AppveyorArtifact inst/CIDatabase/SAM.mdf
Push-AppveyorArtifact inst/CIDatabase/SAM_log.ldf

#-- Use mdf/ldf to create SAM db
$mdfFile = "c:\projects\HCRTools\inst\CIDatabase\SAM.mdf"
$ldfFile = "c:\projects\HCRTools\inst\CIDatabase\SAM_log.ldf"

sqlcmd -S "(local)\SQL2012SP1" -Q "CREATE DATABASE [SAM] ON (FILENAME = '$mdfFile'), (FILENAME = '$ldfFile') for ATTACH"

注意:一直使用https://github.com/hadley/devtools作为R包计算机示例。谢谢你的任何指导!

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

我克隆了您的存储库,并且能够通过在失败命令之前停止SQL服务器并在之后启动它来克服此问题。在RunTests()函数中的travis-tool.sh中看起来像这样。

net stop “SQL Server (SQL2012SP1)” R CMD build ${R_BUILD_ARGS} . net start “SQL Server (SQL2012SP1)”

这有助于避免复制文件问题。但是,我真的不知道SQL服务器是否处于运行状态所需的失败步骤。或者可能根本不需要SQL服务器进行测试,可以在travis-tool.sh之外的测试之前停止。

无论如何,我希望这可以让你知道你能做些什么。

- 伊利亚安德