在R Markdown中重用外部R脚本

Question

使用R Markdown时，我想调用外部R脚本来使用R Markdown文件中指定的值。

实施例。

{r echo=FALSE, warning=FALSE, results='hide', message=FALSE} read_chunk('Analysis of Fulton_L_W relations_All_surveys.R') survey <- "A"

{r Analysis, echo=FALSE, results='hide', message=FALSE, warning=FALSE}

然后我想重新指定indput变量并重新运行脚本

实施例

{r echo=FALSE, warning=FALSE, results='hide', message=FALSE} survey <- "B"

{r Analysis, echo=FALSE, results='hide', message=FALSE, warning=FALSE}

但是，会发生重复的标签错误。但是当我然后使用选项（knitr.duplicate.label =＆＃39;允许＆＃39;）时，第二次分析运行没有完成。我希望这是因为Knitr将这个块重新标记为Analysis-1，这在R脚本中没有指定。

我还尝试通过child-Rmd文件运行脚本，但这也不起作用。

有人可以帮忙吗？

Answer 1

我认为source应该适合你

考虑我有一个名为test.R

的文件

x <- a + b
print(x)

现在，从我的Rmarkdown开始，我将两次test.R来源：

---
title: "Untitled"
output: html_document
---


```{r}
a <- 1
b <- 2

source("test.R")
```

```{r}
a <- 3
b <- 4

source("test.R")
```

这给了我结果