SLURM如何在另一个任务完成时qsub任务？

Question

我目前正在使用基于Linux的HPC，它只使用SLURM提交作业，而HPC只允许工作运行12个小时。但是，我可能需要连续工作24个工作一周才能取得好成绩。

有没有办法在完成后再次（自动）运行作业？

亲切的问候

添加：

作业完成后，将创建.out文件。换句话说，.out文件的数量将增加1。

当.out的数量增加时，是否可以重新排队？

λ_2,...,λ_k

Answer 1

如果您的工作本质上是可重启的，那么您需要做的就是在提交脚本结束时调用sbatch。假设它被称为submit.sh

if ! job_is_done;
then
sbatch submit.sh
fi

job_is_done部分应该被一个命令替换，该命令在作业完成时返回0（即计算完成，进程收敛等），例如通过日志文件中的'grepping'获取某些线索。

您还可以重新排队作业：

job_is_done || scontrol requeue $SLURM_JOB_ID

如果您的程序本身无法重新启动，则可以使用DMCTP之类的包装器使其可重新启动。