Question

当我通过程序中的选项（计算生物学实验）时，我通常会将它们传递给.py文件所以我有这个.py文件，其内容如下：

starting_length=9
starting_cell_size=1000
LengthofExperiments=5000000

然后我执行文件并获取数据。由于程序全部在我的机器上，没有其他人可以访问它，所以它是安全的我也可以很容易地写一个类似的文件：

def writeoptions(directory):
    options=""
    options+="starting_length=%s%s"%(starting_length,os.linesep)
    options+="starting_cell_size=%s%s"%(starting_cell_size,os.linesep)
    options+="LengthofExperiments=%s%s"%(LengthofExperiments,os.linesep)
...
    open("%s%soptions.py"%(directory,os.sep),'w').write(options)

我想传递一个函数作为参数之一：

starting_length=9
starting_cell_size=1000
LengthofExperiments=5000000

def pippo(a,b):
    return a+b
functionoperator=pippo

当然，在真正的实验中，函数pippo会复杂得多。不同于实验到实验。

但我无法做的是自动编写该功能。总之，如果其中一个选项是函数，我不知道如何推广writeoptions函数以继续编写选项。我当然可以复制原始文件，但这样做效率低，效率低（因为它包含许多未使用的额外选项），并且通常无法解决问题。

如何让python写下函数的代码，因为它写下变量的值？

Answer 1

vinko@mithril$ more a.py

def foo(a):
  print a

vinko@mithril$ more b.py

import a
import inspect

a.foo(89)
print inspect.getsource(a.foo)

vinko@mithril$ python b.py
89
def foo(a):
  print a

Answer 2

您可能还会考虑其他一些数据持久性方法。在我自己的（天文学）研究中，我一直在试验两种不同的存储脚本以实现再现性的方法。第一种方法是将它们专门放在subversion存储库中，然后让作业提交脚本自动提交它们。例如，如果您只想在bash中执行此操作：

alias run_py='svn ci -m "Commit before running"; python2.5 $*'

并在脚本内部，为该文件输出前缀为current subversion revision number的输出，您将记录每个运行的脚本以及输入的内容。你可以根据需要将其从颠覆中拉回来。

跟踪函数输入的另一种功能基本上不那么全功能的方法可能是LodgeIt，一种接受XML-RPC输入并附带Python绑定的pastebin。（它可以在本地安装，并且支持回复和更新现有的粘贴。）

但是，如果您正在寻找要包含的相对少量的代码，Vinko使用inspect的解决方案应该可以很好地工作。 Doug Hellman covered the inspect module在他的Python Module of the Week系列中。您可以创建一个装饰器来检查每个选项和参数，然后根据需要将其打印出来（我将使用inspect.getargspec来获取参数的名称。）

import inspect
from functools import wraps

def option_printer(func):
    @wraps(func)
    def run_func(*args, **kwargs):
        for name, arg in zip(inspect.getargspec(func)[0], args) \
                       + sorted(kwargs.items()):
            if isinstance(arg, types.FunctionType): 
                print "Function argument '%s' named '%s':\n" % (name, func.func_name)
                print inspect.getsource(func)
            else:
                print "%s: %s" % (name, arg)
        return func(*args, **kwargs)
    return run_func

这可能会更优雅，但在我的测试中，它适用于简单的参数和变量集。另外，lambdas可能会遇到一些麻烦。

Answer 3

你在问这个吗？

def writeoptions(directory):
    options=""
    options+="starting_length=%s%s"%(starting_length,os.linesep)
    options+="starting_cell_size=%s%s"%(starting_cell_size,os.linesep)
    options+="LengthofExperiments=%s%s"%(LengthofExperiments,os.linesep)
    options+="def pippo(a,b):%s" % ( os.linesep, )
    options+="    '''Some version of pippo'''%s" % ( os.linesep, )
    options+="    return 2*a+b%s" % ( os.linesep, )
    open("%s%soptions.py"%(directory,os.sep),'w').write(options)

还是其他什么？

Answer 4

虽然可以按照你的要求行事（如Vinko所示），但我会说分享代码更清晰。将pippo和他的伙伴放在两个程序都可以访问的子模块中。

Answer 5

为什么不将生成的Python源保存在模块中（ file.py disassemblers和字节码（例如inspect）的主题。 >），以后再导入它？

我建议您采用更标准的方式来处理您所谓的选项。例如，您可以使用JSON模块并保存或恢复数据。或者查看marshal和pickle模块。

你如何让Python写下它在内存中的函数代码？

5 个答案: