Question

以下是我的内容：

Mac OS 10.11 El Capitan
python 2.7.12，从/Library/Frameworks/Python.framework/
PyCharm 2016.2.3
vtk 7.1.0

以下是我的工作：

在本地构建python模块。就我而言，这是vtk。有关摘要，请参阅我配置vtk的CMake调用。

cmake -G Ninja .. -DCMAKE_BUILD_TYPE=Release -DVTK_WRAP_PYTHON=ON -DBUILD_EXAMPLES=OFF -DBUILD_SHARED_LIBS=ON -DBUILD_TESTING=OFF -DCMAKE_INSTALL_PREFIX="/opt/dev/versions/vtk/vtk-7.1.0-shared" -DPYTHON_INCLUDE_DIR="/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/include/python2.7/" -DPYTHON_LIBRARY="/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/libpython2.7.dylib"

将python包安装在python可以找到它的位置。就我而言，这是/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages 请注意，我需要将DYLD_LIBRARY_PATH扩展到lib所在的位置：/opt/dev/versions/vtk/vtk-7.1.0-shared/lib/。
如果我从终端启动python，我可以成功导入vtk。
```
import vtk
v = vtk.vtkVersion()
print v.GetVTKVersion()
```

如果我尝试在PyCharm的python控制台中导入vtk，我会收到以下错误：

Traceback (most recent call last):
  File "/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages/IPython/core/interactiveshell.py", line 2881, in run_code
    exec(code_obj, self.user_global_ns, self.user_ns)
  File "<ipython-input-2-b7e11aadda62>", line 1, in <module>
    import vtk
  File "/Applications/PyCharm.app/Contents/helpers/pydev/_pydev_bundle/pydev_import_hook.py", line 21, in do_import
    module = self._system_import(name, *args, **kwargs)
  File "/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages/vtk/__init__.py", line 41, in <module>
    from .vtkCommonCore import *
  File "/Applications/PyCharm.app/Contents/helpers/pydev/_pydev_bundle/pydev_import_hook.py", line 21, in do_import
    module = self._system_import(name, *args, **kwargs)
  File "/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages/vtk/vtkCommonCore.py", line 9, in <module>
    from vtkCommonCorePython import *
  File "/Applications/PyCharm.app/Contents/helpers/pydev/_pydev_bundle/pydev_import_hook.py", line 21, in do_import
    module = self._system_import(name, *args, **kwargs)
ImportError: No module named vtkCommonCorePython

到目前为止，我了解问题是由El Capitan引入的System Integrity Protection（SIP）引起的。其中一个影响是子进程只有restricted access到其他资源，而且很可能，PyCharm将python作为单独的进程执行。

我也明白python无法导入vtk，因为它无法找到python模块链接到的dylib。我可以通过两种方式验证这一点：

DYLD_LIBRARY_PATH为空。这是因为python在PyCharm中作为子进程运行：os.getenv('DYLD_LIBRARY_PATH')返回None。
当我将所有库从/opt/dev/versions/vtk/vtk-7.1.0-shared/lib/复制到当前工作目录时，我可以导入模块

现在问题：显然，DYLD_LIBRARY_PATH不能在子进程中使用，因此自El Capitan以后就不应再使用了DYLD_LIBRARY_PATH。那么，如何正确地取代这个＆＃34;连接黑客＆＃34;在MacOS 10.11之前完美运行。？有没有办法继续使用DYLD_LIBRARY_PATH？

禁用SIP不是一种选择。显然，将dylib复制到当前工作目录会有所帮助，但这对我来说是不可行的。然而，将lib放在站点包位置（vtk）并不会有帮助。

我很确定很多人一直依赖select b* from table a, table b where a.check = b.check - 黑客，现在正在努力解决SIP的后果 - 这就是为什么我认为社区可能会从中受益冗长的问题。

Answer 1

经过长时间的斗争，我能够解决问题的最后一点。

通过为已安装二进制文件的RPATH Run-Path dependent Libraries设置固定值，我的链接问题就消失了。

实现这一目标有不同的可能性。我想一个选择是使用install_name_tool。对我来说，最简单的是用适当的CMake标志构建vtk。在此，我更新了cmake，其中CMAKE_MACOSX_RPATH和CMAKE_INSTALL_RPATH有所不同：

    cmake -G Ninja .. -DCMAKE_BUILD_TYPE=Release \
              -DVTK_WRAP_PYTHON=ON \
              -DBUILD_EXAMPLES=OFF \
              -DBUILD_SHARED_LIBS=ON \
              -DBUILD_TESTING=OFF \
              -DCMAKE_INSTALL_PREFIX="/opt/dev/versions/vtk/vtk-7.1.0-shared" \
              -DCMAKE_MACOSX_RPATH=ON \
              -DCMAKE_INSTALL_RPATH="/opt/dev/versions/vtk/vtk-7.1.0-shared/lib" \
              -DPYTHON_INCLUDE_DIR="/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/include/python2.7/" \
              -DPYTHON_LIBRARY="/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/libpython2.7.dylib"

阅读here有关CMake的rpath处理的更多信息。请注意，otool -L vtkCommonCorePython.so（例如）仍会在输出中写入@rpath，但值仍然是固定的。

@rpath/libvtkCommonCorePython27D-7.1.1.dylib (compatibility version 0.0.0, current version 0.0.0)
@rpath/libvtkWrappingPython27Core-7.1.1.dylib (compatibility version 0.0.0, current version 0.0.0)
/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Python (compatibility version 2.7.0, current version 2.7.0)
@rpath/libvtksys-7.1.1.dylib (compatibility version 0.0.0, current version 0.0.0)
@rpath/libvtkCommonCore-7.1.1.dylib (compatibility version 0.0.0, current version 0.0.0)
/usr/lib/libc++.1.dylib (compatibility version 1.0.0, current version 120.1.0)
/usr/lib/libSystem.B.dylib (compatibility version 1.0.0, current version 1226.10.1)

自Mac OS 10.11 El Capitan以及系统完整性保护

1 个答案: