对data.frame或matrix中的行求和

Question

我有一个非常大的数据框，其中行作为观察，列作为遗传标记。我想创建一个新列，其中包含使用R的每个观察的选定列数的总和。

如果我有200列和100行，我想创建一个包含100行的新列，其中列为43到167列。列有1或0.使用包含每行的总和，我将能够对具有最多遗传标记的个体进行排序。

我觉得这很接近：

data$new=sum(data$[,43:167])

Answer 1

您可以使用rowSums

rowSums(data)应该会给你你想要的东西。

Answer 2

rowSums函数（正如Greg提到的那样）会做你想要的，但你在答案中混合了子集化技术，在使用“[]”时不要使用“$”，你的代码看起来应该更像：

data$new <- rowSums( data[,43:167] )

如果你想使用除sum之外的函数，那么看看？申请在行或列中应用一般函数。

Answer 3

我来到这里是希望找到一种方法来获取数据表中所有列的总和，并遇到实现上述解决方案的问题。使用cbind函数将一列与所有列的和相加的方法：

cbind(data, total = rowSums(data))

此方法将total列添加到数据中，避免了使用上述解决方案尝试对所有列求和时产生的对齐问题（有关此问题的讨论，请参见下面的帖子）。

Adding a new column to matrix error

Answer 4

这也有帮助，但毫无疑问，最好的选择是 rowSums 函数：

data$new <- Reduce(function(x, y) {
  x + data[, y]
}, init = data[, 43], 44:167)