根据路径列表将数据文件导入列表

时间:2016-10-07 13:26:29

标签: r list csv

我有大量按每个类别组织的.csv数据文件。我想将它们导入到每个类别的列表中。

为此,我已经为每个类别创建了一个路径文件列表:

path_list <- list(a = c("path1","path2"), b= c("path3", "path4","path5"))

然后,我希望将“.csv”文件读入与path_list具有相同结构的新列表中:

data_list <- vector("list", length(path_list))

names(data_list) <- names(path_list)

for(i in 1:length(data_list)) { 
  for (j in 1:3)) {

  data_list[[i]] <- read.csv(path_list[[i]][[j]], header=T, na.strings = "", stringsAsFactors = F)

  print (i)

  }
}

这适用于path_list$a的前两个元素,但后来我收到了错误:

Error in path_list[[i]][[j]] : subscript out of bounds

我知道的是因为j在实际j循环1:3时只有两个元素。有没有办法让j为每个列表元素动态化?

最终结果应如下所示:

data_list
$a
[1] "datafile1" "datafile2"

$b
[1] "datafile3" "datafile4" "datafile5"

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

它是越界的,因为并非path_list的所有元素都是长度为3的向量。以下作品:

data_list <- setNames(vector("list", length(path_list)), names(path_list))
l <- lengths(path_list)    ## length of each vector

for(i in 1:length(data_list)) {
  tmp <- vector("list", l[i])
  for (j in 1:l[i])) {
     tmp[[j]] <- read.csv(path_list[[i]][j], header=TRUE, na.strings = "", stringsAsFactors = FALSE)
     }
  data_list[[i]] <- tmp
  }