我在R包中包含的一部分功能涉及填充NAs
并结束最后一次保存(locf
)。 locf应该被实现到数据框中的所有列,除了我在好列goodcols
下面调用的那些(即应该应用于badcols
)。 badcols
的列名可以是任何内容。我使用下面的locf
函数和for循环来实现这一点。但是,使用大数据集时,for循环有点慢。在所呈现的场景中,任何人都可以提出更快的替代方案或其他填充NA的方法吗?
以下是一个示例数据框:
#Test df
TIME <- c(0,5,10,15,20,25,30,40,50)
AMT <- c(50,0,0,0,50,0,0,0,0)
COV1 <- c(10,9,NA,NA,5,5,NA,10,NA)
COV2 <- c(20,15,15,NA,NA,10,NA,30,NA)
ID <- rep(1, times=length(TIME))
df <- data.frame(ID,TIME,AMT,COV1,COV2)
df <- expand.grid(df)
goodcols <- c("ID","TIME","AMT")
badcols <- which(names(df)%in%goodcols==F)
#----------------------------------------------------
#locf function
locf <- function (x) {
good <- !is.na(x)
positions <- seq(length(x))
good.positions <- good * positions
last.good.position <- cummax(good.positions)
last.good.position[last.good.position == 0] <- NA
x[last.good.position]
}
#------------------------------------------------------
#Now fill in the gaps by locf function
for (i in badcols)
{
df[,i] <- locf(df[,i])
}
答案 0 :(得分:2)
很抱歉写了一个答案(没有足够的声誉来评论)
但是什么阻止你做@ProcrastinatusMaximus说的?
(您可以在循环中包含zoo
调用)
看起来像这样:
for (i in badcols)
{
df[,i] <- zoo::na.locf(df[,i])
}
我不确定zoo
是否比您的实施更快。你必须试试这个。您还可以检查spacetime::na.locf
,imputeTS::na.locf
,了解哪些现有locf
实施最快。