Question

我在从mac on Mac（Mac OS X 10.11.2）访问我的MySQL数据库时遇到问题。以下代码：

library("RODBC")
mycom  <- odbcConnect("wsn_mysql_5", uid="root", pwd="*****")

给出了这个错误：

1: In RODBC::odbcDriverConnect("DSN=wsn_mysql_5;UID=root;PWD=****") :
[RODBC] ERROR: state 00000, code 15509574, message 
[iODBC][DriverManager]dlopen(/usr/local/lib/libmyodbc5a.so, 
6): no suitable image found.  Did find:
/usr/local/lib/libmyodbc5a.so: mach-o, but wrong architecture
2: In RODBC::odbcDriverConnect("DSN=wsn_mysql_5;UID=root;PWD=****") :
[RODBC] ERROR: state IM003, code 15509574, message 
[iODBC][Driver Manager]Specified driver could not be loaded

到目前为止我尝试过：

我安装了iODBC驱动程序管理器3.52.12。
我安装了MySQL连接器odbc-5.3.6-osx10.11-x86-64bit并创建了一个DSN（server = localhost，user = root，password = *****，database = wsn_db）。

我在iODBC管理员中测试时遇到此错误：

[iODBC][Driver manager]dlopen(/usr/local/lib/libmyodbc5w.so, 6): no suitable image found. 
Did find: /usr/local/lib/libmyodbc5w.so: mach -o, but wrong architecture.

How to add ODBC to MAMP on OSX让我认为这是一个32位与64位的问题。

所以我安装了MySQL连接器odbc-5.2.7-osx10.7-x86-32bit，这是我发现的最新32位版本。当我用iODBC管理员测试时，它似乎工作，但是当我在R中尝试代码时，我得到了开头提到的错误。

iODBC的常见问题解答说明了以下类型的错误：

[iODBC] [驱动程序管理器]无法加载指定的驱动程序

为什么会出现这种情况有几个原因，并且通过体系结构进行思考会有所帮助。您的应用程序已成功加载libiodbc，并且已找到odbc.ini文件（或通过ODBCINI环境变量等效），并且在该odbc.ini中找到了与您的连接中请求的名称匹配的DSN。

但是，驱动程序管理器在加载`Driver =＆＃39;中指定的库时遇到问题。 DSN定义的一行。要么它不存在，要么它的权限不足以允许你的应用程序加载它（它必须是可读的和可执行的，并且导致它的目录必须是可执行的），或者文件可能不是动态库 - 它可以是一个静态库（除了AIX之外的* .a文件）或者是否已损坏。这些都是要检查的东西，或者如果所有权限都签出，您最好重新安装驱动程序。

所以我检查了许可，但他们是正确的。
我也重新安装了驱动程序，但它没有改变任何内容。
阅读this后，我检查了odbc.ini和obdcinst.ini。

我将odbc.ini改为：

[ODBC Data Sources]
wsn_mysql_7 = wsn_mysql_7

[ODBC]
TraceLibrary=

[wsn_mysql_7]
 Driver = /usr/local/lib/libmyodbc5w.so
 DATABASE = wsn_db
 DESCRIPTION = DSN for wsn_db in R
 SERVER = localhost
 UID = root
 PASSWORD = *****

和odbcinst.ini到

[ODBC Drivers]
MySQL ODBC 5.2 ANSI Driver=Installed
MySQL ODBC 5.2 Unicode Driver=Installed

[ODBC Connection Pooling]
PerfMon=0
Retry Wait=

[MySQL ODBC 5.2 ANSI Driver]
Driver = /usr/local/lib/libmyodbc5a.so
Description = mySQL driver
Threading = 0

[MySQL ODBC 5.2 Unicode Driver]
Driver = /usr/local/lib/libmyodbc5w.so
Description = mySQL driver
Threading = 0

但它似乎没有改变任何东西。

我还尝试了基于this question的替代RODBC代码。

mycom <- odbcDriverConnect("Provider=MSDASQL;Driver={MySQL ODBC 5.2 UNICODE Driver};
Server=localhost;database=wsn_db;Uid=root;Pwd=*****;Option=3")

我不确定下一步该做什么？即使是以完全不同的方式访问R中的mySQL数据也会有所帮助。

Answer 1

我终于通过使用unixODBC和使用64位ANSI连接器来管理工作配置。如果您尝试使用RODBC连接到MySQL数据库，我建议：

按照this tutorial安装unixODBC和RODBC
安装最新的MySQL ODBC connector。我安装了mysql-connector-odbc-5.3.6-osx10.11-x86-64bit。我必须从tar安装，因为安装程序不起作用。说明是here。
我使用ODBC Administrator配置DSN，但我想[Hiltmon教程]的指令也可以正常工作。

我首先使用了Unicode驱动程序，但出现了以下错误：

Warning messages:
1: In RODBC::odbcDriverConnect("DSN=wsn_db_dsn;UID=root;PWD=****") :     
[RODBC] ERROR: state H, code 0, message [unixODBC][
2: In RODBC::odbcDriverConnect("DSN=wsn_db_dsn;UID=root;PWD=****") :
ODBC connection failed

我通过选择RODBC error - ODBC connection failed - can't connect to MySQL with my mac (mavericks)中建议的ANSI驱动程序来纠正此问题。

我希望这可以为某人节省时间。

在Mac OS X上访问R中的MySQL数据库

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