如何修改终端程序的选项?

时间:2016-09-27 20:48:00

标签: linux terminal bioinformatics

Terminal

参见上面的终端图片。运行程序时如何修改“允许的选项”?例如:如何修改错误率?

我认为你不应该关注程序是什么,它只是一个语法问题。我在运行程序时尝试在行中的不同位置放置“--error_rate arg 0.1”,但它不会运行。

这可能非常简单,我只是在终端上开始。

1 个答案:

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如果要设置标志的值" error_rate"到" 0.05",您可以使用:

./sim_reads --error_rate 0.05 yourfile1 yourfile2

如果你还想设置旗帜"深度"到" 30",您可以使用:

./sim_reads --error_rate 0.05 --depth 30 yourfile1 yourfile2

注意:

  • 在两个示例中, yourfile1 yourfile2 必须根据程序的用法用实际文件名替换。你无法直接输入" yourfile1"。

  • 必须使用两个破折号。你不能在旗帜前面使用一个破折号。

  • 不得包含字面词" arg"。它出现在标志列表中以显示放置参数的位置。

这是几乎所有Unix工具的标准惯例。