我正在使用二分包来绘制植物传粉者的相互作用。我将原始数据转换为包使用的数据框并绘制网页。但我希望情节中的相互作用的颜色对于一个物种(B.griseocollis)是不同的,我不能让它起作用。
以下是我的代码:
frame2webs(bombus_rxc, varnames= c("ID","beesp","trtmnt"), type.out="list",
emptylist=TRUE)
f2w <- frame2webs(bombus_rxc, varnames= c("ID","beesp","trtmnt"),
type.out="list", emptylist=TRUE)
仅供参考“pbg”是我所拥有的“trtmnts”之一
plotweb(f2w$pbg)
plotweb(f2w$pbg, col.interaction = ifelse(as.character(bombus_rxc$beesp) ==
"B.griseocollis", "cyan4", "grey80"))
其中两个互动转向青色而不是正确的两个。我发现没有人拥有我的数据集但只是好奇我的col.interaction语句中的参数是否有明显错误
答案 0 :(得分:1)
当你调用你的颜色时,你正在调用一个与最终情节不符的矢量。
这是一个粗略的可重复示例(您应该尝试为数据制作这些示例,以便更轻松地回答您的问题):
bombus_rxc=mtcars
bombus_rxc$ID=rownames(bombus_rxc)
bombus_rxc$beesp=bombus_rxc$carb
bombus_rxc$trtmnt=rep(c("pbg","abc"))
bombus_rxc
以下是如何使情节有效:
frame2webs(bombus_rxc, varnames= c("ID","beesp","trtmnt"), type.out="list",
emptylist=TRUE)
f2w <- frame2webs(bombus_rxc, varnames= c("ID","beesp","trtmnt"),
type.out="list", emptylist=TRUE)
plotweb(f2w$pbg)
plotweb(f2w$pbg,col.interaction=ifelse(colnames(f2w$pbg)==1,"cyan4","grey80"))
希望它适用于您的真实数据!