RStudio：为每个.Rproj使用不同的软件包版本

Question

我正在使用一些较旧的R项目，这些项目依赖于目前已弃用的（或经过大量修改的）多个软件包。为了使所有内容顺利运行，我使用了旧版本的这些软件包，我已将其保存在另一个文件夹中，并在必要时将手动加载到%userprofile%\documents\R\win-library\3.3。但是，这不方便，特别是如果我想同时运行多个项目，其中一些项目需要新的和更新版本的软件包。

我的问题 - 有没有办法为每个.Rproj指定自定义目录，从中加载库？

Answer 1

你可以解决这个更简单的：

1. 为每个项目设置一个顶级目录，致电projA，projB，...
2. 在其中的每一个中，创建一个目录libs/，比方说。
3. 在每个目录中都有一个文件.Rprofile，其中包含.libPaths("./libs")
等单一作业

现在当你在不同的项目目录中启动R时，每个项目目录前面都会有一个单独的库目录，允许你在那里放置每个项目的覆盖。

简而言之，此处的方法概述允许您随意保留本地和已修改的包。 （如果您愿意，您甚至可以通过.libPaths()分配公共目录。）

好的事情是这将

1. 使用任何R调用，批处理或GUI或RStudio或闪亮或......
2. 不依赖于任何其他工具，因此
3. 不依赖于RStudio或.Rprof文件 - 尽管您也可以自由使用RStudio。

经常会有Base R为你服务。

Answer 2

一种选择是使用Revolution Analytics的checkpoint包。

您可以为项目中的每个主R文件指明您希望加载一组软件包的日期。您可以阅读更多相关信息here。

要从镜像中的给定日期提取快照包，请使用getValidSnapshots(mranRootUrl = mranUrl())。

创建检查点：

# Create temporary project and set working directory

example_project <- paste0("~/checkpoint_example_project_", Sys.Date())

dir.create(example_project, recursive = TRUE)
oldwd <- setwd(example_project)


# Write dummy code file to project

cat("library(MASS)", "library(foreach)",
    sep="\n",
    file="checkpoint_example_code.R")

# Create a checkpoint by specifying a snapshot date

library(checkpoint)
checkpoint("2014-09-17")

# Check that CRAN mirror is set to MRAN snapshot
getOption("repos")

# Check that library path is set to ~/.checkpoint
.libPaths()

# Check which packages are installed in checkpoint library
installed.packages()

# cleanup
unlink(example_project, recursive = TRUE)
setwd(oldwd)