Question

我们的R安装定义于：

R$HOME/etc/Makeconf that CC = gcc -std=gnu99

我有一个需要使用

编译的特定包（C ++和C代码的混合）

  CC = gcc

没有-std=gnu99

据我了解，我有3种方法可以做到这一点：
1）系统范围，编辑R $ HOME / etc / Makeconf
2）以每个用户为基础，玩〜/ .R / Makevars
3）每个包的基础上，设置PACKAGE / src / Makevars

即使1和2不是我想要的，我使用1和2

测试了3个选项

R CMD INSTALL -l pack.tgz可以＆＃34; gcc -std = gnu99＆＃34;被＆＃34; gcc＆＃34;

取代

但是当使用PACKAGE/src/Makevars方法时，它会失败

我必须承认我此时已经迷失了，我应该在哪里看？

修改。这与Building R Packages using Alternate GCC并不重复我确实读过上一篇文章。这是指向Makevars的那篇

我关键的一点是 PACKAGE / src / Makevars 不考虑CC =备用编译器而其他人正在完美地工作。

Answer 1

我在fortran遇到过类似的问题。无论如何，我制作了你的包装模型，我发现了一半的解决方案。似乎并未考虑和使用PACKAGE/src/Makevars中的所有变量。为了使其工作，我使用了这个Makevars文件：

MY_PKG_LIBS =
MY_PKG_CCLAGS = -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -fpic  -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g

all: $(SHLIB)                      
hello.o: hello.c
        gcc $(MY_PKG_CCLAGS) -c hello.c -o hello.o $(MY_PKG_LIBS)

PKG_LIB = -std=gnu++11

显然，hello.c文件应由your_file_name.c替换。如果您无法更改CC并采用我的解决方法，那么真正的问题就是在创建共享文件.so时，应使用PKG_CFLAGS或{{1}覆盖编译器标志如Writing R Extensions中所述（再次在PKG_CPPFLAGS文件中）。在我的个人情况（Ubuntu 15.04，R 3.1.2）中，我按照Makevars文件中的指南尝试了这些和其他变种：

/etc/R/Makeconf

在向ALL_CFLAGS = $(R_XTRA_CFLAGS) $(PKG_CFLAGS) $(CPICFLAGS) $(SHLIB_CFLAGS) $(CFLAGS) ALL_CPPFLAGS = $(R_XTRA_CPPFLAGS) $(PKG_CPPFLAGS) $(CPPFLAGS) $(CLINK_CPPFLAGS)最终编译包中添加标志的唯一方法是在{{1}中添加库链接器标志（正如我最初使用我的fortran代码）-shared }}。我安装软件包的最终结果是：

PKG_LIB = -std=gnu++11

R ::使用Makevars覆盖C编译器

1 个答案: