用于在一个或多个变量的范围内选择观察值(dplyr)

时间:2016-09-19 16:41:57

标签: r dplyr subset data-manipulation

我有一个应用程序,我想定义一个允许观察的函数 根据一个范围内的条件从数据集中选择 或更多变量。这在直接R代码中相当简单,但是我希望有一个数据驱动函数可以将这些条件作为参数,并允许更一般的条件。

这是一个简单的例子

set.seed(1234)
n <- 100
testdat <- data.frame(
            X = round(rnorm(n, mean=10, sd=3), 2),
            Y = rnorm(n, mean=8, sd=2),
            NL = sample(2:10, n, replace=TRUE)
            )

使用范围数据框

说我想选择0 <= X < 100 <= Y < 8的观察结果。我可以这样做:

# define a handy utility function 
within <- function(x, a, b)
    (!is.na(x)) & (x >= a) & (x <= b)

# specify ranges for variables
ranges <- data.frame(X = c(0,10), Y= c(0,8))

# calculate acceptance
OK <- rep(TRUE, n)
for (col in colnames(ranges)) {
    OK <- OK & within(testdat[, col], ranges[1,col], ranges[2,col])
}
# select
testdat[OK,]

证明:

plot(Y ~ X, data=testdat, col=1+OK, pch=(15:16)[1+OK])
abline(v=ranges$X, h=ranges$Y, col="gray")

enter image description here

这很容易定义为函数:

Select <- function(x, ranges) {
    OK <- rep(TRUE, nrow(x))
    for (col in colnames(ranges)) {
        OK <- OK & within(x[, col], ranges[1,col], ranges[2,col])
    }
    x[OK,]
}

使用dplyr

使用dplyr执行此类操作要简单得多且灵活得多,但是我无法看到如何将其转换为可以采用任意数量条件的函数。

dplyr相同的例子:

selected <- testdat %>%
    filter( within(X, 0,10), within(Y, 0,8) ) 

,或者

selected <- testdat %>%
    filter( X < median(X), Y < median(Y) ) 

通缉:具有以下调用的函数,其中...对应于涉及x

中变量的其他逻辑表达式
Select <- function(x, condition, ...) {
   # what goes here ???
}

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

更新:这是该功能的更新版本,旨在提供更直观的方式来添加选择条件。条件作为列表传递。每个列表元素都是一个包含三个元素的向量,列名,下限和上限。只需在列表中添加更多元素即可添加更多列选择条件。这是函数,后面是三个例子:

my_subset = function(data, conditions) {

  vars = sapply(conditions, function(x) x[1])
  gt = sapply(conditions, function(x) x[2])
  lt = sapply(conditions, function(x) x[3])

  data %>% 
    filter_(paste(vars, "<=", lt, collapse=" & ")) %>%
    filter_(paste(vars, ">=", gt, collapse=" & "))
}

testdat %>% my_subset(list(c("X",4,10), c("Y",10,Inf)))

iris %>% my_subset(list(c("Sepal.Width",3.2,3.5), c("Petal.Width",0,0.2)))

mtcars %>% my_subset(list(c("mpg",20,25), c("wt", 2.5, Inf), c("hp", 0, 100)))

原始答案

这是一个dplyr函数,它将采用任意数量的条件并返回子集化数据帧。我们使用paste将传递给函数的条件放在一起。

my_subset = function(data, vars, gt=NULL, lt=NULL) {

  if(!is.null(lt)) {
    data = data %>% 
      filter_(paste(vars, "<", lt, collapse="&"))
  }

  if(!is.null(gt)) {
    data = data %>% 
      filter_(paste(vars, ">", gt, collapse="&"))
  }

  data
}

现在对样本数据运行该函数:

my_subset(testdat, c("X","Y"), gt=c(4,3), lt=c(8,6))

testdat %>% my_subset(c("X","Y"), gt=c(4,3), lt=c(8,6))
     X        Y NL
1 7.67 5.780466 10
2 6.93 4.973424  5
3 7.87 5.656103  5
4 5.11 4.699798  4
5 5.98 4.103508 10
6 7.68 5.893234  7
7 5.83 5.752474  6
iris %>% my_subset(c("Petal.Width","Sepal.Length"), lt=c(0.3,4.5))
  Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Species
1          4.4         2.9          1.4         0.2  setosa
2          4.3         3.0          1.1         0.1  setosa
3          4.4         3.0          1.3         0.2  setosa
4          4.4         3.2          1.3         0.2  setosa