Question

我有一些使用以下

按顺序排列的行

grep ENSG00000006114 File | sort -V 
chr17   35874900    35879174    ABCD0000006114:I25  -
chr17   35874901    35879174    ABCD0000006114:I25  -
chr17   35875548    35875671    ABCD0000006114:E27  -
chr17   35875672    35877289    ABCD0000006114:I26  -
chr17   35877290    35877445    ABCD0000006114:E26  -
chr17   35877446    35877932    ABCD0000006114:I25  -

但是我想要删除包含＆＃39;的第一行：I＆＃39;在第一行直到我得到＆＃39;：E＆＃39;因为我一直在尝试像

这样的东西

grep ENSG00000006114 File | sort -V | awk '{if ($4 ~ /:I/ && NR==1) next};1'

但是，对于前几行，可能会出现多次出现，因此如何排除包含以下内容的行：I直到第一行：E出现在第一行，这样我的最终结果将是：

   chr17   35875548    35875671    ABCD0000006114:E27  -
   chr17   35875672    35877289    ABCD0000006114:I26  -
   chr17   35877290    35877445    ABCD0000006114:E26  -
   chr17   35877446    35877932    ABCD0000006114:I25  -

Answer 1

假设由于您的输入文件很大，grep + sort在该顺序中很有用，您只需要从awk获取：

grep ENSG00000006114 File | sort -V | awk '$4~/:E/{f=1} f'

如果文件不大，你可能会失去grep：

sort -V File | awk '!/ENSG00000006114/{next} $4~/:E/{f=1} f'

Answer 2

你可以使用这个awk：

grep ENSG00000006114 File | sort -V |
awk 'p==1 && $4 ~ /:E/{p=2} !p && $4 ~ /:I/{p=1} p==1{next} 1'

chr17   35875548    35875671    ABCD0000006114:E27  -
chr17   35875672    35877289    ABCD0000006114:I26  -
chr17   35877290    35877445    ABCD0000006114:E26  -
chr17   35877446    35877932    ABCD0000006114:I25  -

当p==0＆amp;＆amp; $4匹配:I，然后我们设置p=1
p==1我们跳过该记录并转到下一个
当p==1＆amp;＆amp; $4匹配:E，然后我们设置p=2，从而允许打印剩余记录。

Answer 3

您也可以将其重定向回grep：

$ grep ENSG00000006114 File | sort -V  | grep -A 10000000000000000 :E
chr17   35875548    35875671    ABCD0000006114:E27  -
chr17   35875672    35877289    ABCD0000006114:I26  -
chr17   35877290    35877445    ABCD0000006114:E26  -
chr17   35877446    35877932    ABCD0000006114:I25  -

删除第一行，直到列中的正则表达式出现

3 个答案: