我试图将两条回归线放入同一个图中。我可以使用下面的代码,但使用相同颜色的行:
model1 <- glm(species~logarea, family=poisson, data=fish)
model2 <- glm.nb(species~logarea, data=fish)
plot(species~logarea,data=fish)
lines(fitted(model1)[order(logarea)]~sort(logarea),data=fish)
lines(fitted(model2)[order(logarea)]~sort(logarea),data=fish)
我正在考虑使用ggplot复制上面的图,这样我就可以显示不同颜色的不同线条。但我无法弄清楚如何去做。
我只完成了绘制散点图的第一步,但不知道如何在其上添加线条。
ggplot(fish,aes(fish$logarea,fish$SPECIES))+geom_point()
我做了一些搜索,我知道我可以使用geom_smooth(method =“glm”)来生成回归线。但它似乎并非基于我建立的模型。
有人可以对此有所了解吗?
非常感谢。
答案 0 :(得分:4)
只需添加geom_line(aes(y=fitted_datas))
,例如:
data("mtcars")
library(ggplot2)
model <- glm(mpg~hp, family=poisson, data=mtcars)
ggplot(mtcars,aes(hp,mpg))+geom_point()+geom_line(aes(y=fitted(model)))
结果:
答案 1 :(得分:2)
您可以直接在geom_smooth
中拟合模型。在这种情况下,您需要使用method.args
参数为拟合方法提供额外的参数,以定义glm
的族。
这是一个示例,为每个模型类型添加不同的颜色。我使用se = FALSE
删除置信区间。
ggplot(fish,aes(logarea, SPECIES)) +
geom_point() +
geom_smooth(method = "glm", method.args = list(family = poisson), aes(color = "poisson"), se = FALSE) +
geom_smooth(method = MASS::glm.nb, aes(color = "NB"), se = FALSE)