Question

下午好。

我现在已经挣扎了一段时间，虽然我可以在网上找到类似的问题，但我发现的任何东西都无法真正帮助我解决它。

从包含三列（x，y和y的错误）的标准数据文件（.csv或.txt）开始，我想读入数据并生成包含误差线的线图。

我可以毫无问题地绘制x和y值，但如果我想使用matplotlib.pyplot errorbar实用程序添加错误栏，我会收到以下错误消息：

ValueError: yerr must be a scalar, the same dimensions as y, or 2xN.

如果我使用一些任意数组（numpy或plain python），下面的代码可以工作，但不能从文件中读取数据。我尝试使用asarray将我从输入代码中获取的元组转换为numpy数组，但无济于事。

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt

row = []
with open("data.csv") as data:
    for line in data:
        row.append(line.split(','))

column = zip(*row)

x = column[0] 
y = column[1]
yer = column[2]

plt.figure() 
plt.errorbar(x,y,yerr = yer)

fig = plt.gcf()
fig.set_size_inches(18.5, 10.5)
fig.savefig('example.png', dpi=300)

一定是我忽略了什么。我对此事的任何想法都非常感激。

Answer 1

yerr应该是y值中的加/减错误。在您的情况下，添加的等于减去的等于第三列的一半。

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt

data = np.loadtxt('data.csv', delimiter=',')

plt.figure()
yerr_ = np.tile(data[:, 2]/2, (2, 1))
plt.errorbar(data[:, 0], data[:, 1], yerr=yerr_)
plt.xlim([-1, 3])
plt.show()

data.csv

0,2,0.3
1,4,0.4
2,3,0.15

matplotlib.pyplot errorbar ValueError取决于数组长度？

1 个答案: