Question

我试图合并两个数据框A和B.根据object_size()，A有大约45,000行和25列，大小为7.39 MB。 B有大约122,000行和36列，但合并中只涉及2列。 B的大小为32.6 MB。这是我的合并代码：

A <- merge(x=A, y=B[,c("col1","col2")], by="col1", all.x=TRUE, all.y=FALSE)

当我尝试运行合并时：我收到以下错误消息：

Error: cannot allocate vector of size 6.6 Gb
In addition: Warning messages:
1: In merge.data.frame(x = bat.2007.2014, y = mlb.ebis.keys[, c("player_id",  :
  Reached total allocation of 12186Mb: see help(memory.size)
2: In merge.data.frame(x = bat.2007.2014, y = mlb.ebis.keys[, c("player_id",  :
  Reached total allocation of 12186Mb: see help(memory.size)
3: In merge.data.frame(x = bat.2007.2014, y = mlb.ebis.keys[, c("player_id",  :
  Reached total allocation of 12186Mb: see help(memory.size)
4: In merge.data.frame(x = bat.2007.2014, y = mlb.ebis.keys[, c("player_id",  :
  Reached total allocation of 12186Mb: see help(memory.size)

我正在运行Windows 10和R版本3.3.1（64位）。我的机器有12 GB的RAM。

这两个数据框似乎都是中等大小。为什么我的内存不足？

Answer 1

如果检查通过合并您colnames，严丝合缝。我有一个类似的问题，很可能是这种内存分配异常的原因。是的，主元是应该总是唯一的。

合并数据帧时R不能分配矢量

1 个答案: